Forum "Recherche d'ORF"

Thread subject: annotation 1

[ Return to forums ]
annotation 1
original
22 Nov 2007 20:59
Contribution: Refer to Rule Book & FAQ
Juste avant que je vous poste la première séquence, vous signalez qu'il faut prendre garde à clarifier les champs en mettant dans le bloc-notes bon nombre d'informations
obtenues lors des recherches. Je prends donc le temps de le faire notamment pour les multiples résultats d'ORF finder initialement placés dans les champs
"recherche d'ORF". Conclusion je me fais taper sur les doigts lors de la correction par ce que ceux-ci n'y sont pas. Alors quoi ?
Que faut-il prendre en compte?
Ps: il serait sympa de se mettre dans la peau des néophytes que nous sommes avant de poster des messages pas clairs.

Hingamp_BC07
22 Nov 2007 21:32
Game master
Que faut-il prendre en compte? Ce qui a été dit et écrit; si vous n'êtes pas sûrs, nous sommes là en TD pour vous répondre. Il y a aussi un forum pour éclairer vos lanternes. On peut surement faire mieux, mais de là à nous reprocher de ne pas faire des efforts...

Dans le message cité j'ai écrit "ne conservez dans les différents champs (ORF, BLAST etc) que les résultats qui servent à votre discussion"; dans la mesure où vous allez discuter de l'ORF le plus long, il faut bien nous montrer les ORF obtenus, non? Retirer tous les ORFS sauf celui que vous avez retenu est du même ordre qu'effacer tous les résultats du BLAST qui ne vous intéressent pas, ou d'effacer sur la photo d'un gel les petites bandes 'sans importance'...

Dans ce même post cité j'écris: "si par exemple vous avez fait deux BLAST qui donnent des résultats identiques, n'en conservez qu'un seul dans le champ BLAST". Les recherches d'ORF sur les deux brins n'ont pas donné les mêmes résultats, et les deux résultats sont nécessaires pour identifier le plus long ORF, non?

En résumé je n'ai jamais dit qu'il fallait mettre au bloc note "bon nombre d'informations", j'ai dit qu'il fallait y mettre les informations qui ne servent à rien.

Ai-je été suffisamment clair à votre goût?