Forum "Analyse phylogénétique"

Thread subject: problème outil id2fasta

[ Return to forums ]
problème outil id2fasta
Alirion
27 Oct 2011 11:44
Non evaluated contribution
Nom de séquence erroné (gammapro au lieu de archae)?

>Gammapro1 Candidatus/Gammaproteobacteria/gi|269986446| gi|269986446|gb|EEZ92732.1| CoA-binding domain protein [Candidatus Parvarchaeum acidiphilum ARMAN-4]
MKDNNPECSIEEHENILKMPKDQHSDGEIKDILSKYKKVAVVGMSREEGKESHDIPKYLISKGYDVTPVNPNADLILNKK
SYSSVSDVPGRVDIVDIFRPSDKVLPVVQAAISKSPKVIWMQEGISNDEAKKLAESKGITVIFNRCMMKEHVRLFGN
P_Hingamp_11
27 Oct 2011 19:02
Game master
C'est réparé (problème était dû à la confusion entre "Candidatus" qui peut être Gammaproteobacteria ou Euryarchaeota)...
christinechloe
11 Dec 2011 18:16
Contribution: Incomprehensible
        

>TARA23S_2559010 Traduction [202-873 sens indirect]
FFYFYILHLEILGFLTIYDFMEEEQNQNPEIKNHDEKATDNDVKDAASNDTESEKKPEEIVLELEDKLTRTFAEMENQRRRFEKEKDEAFEYGGFAFAKE
ALSLIDNLERSRQILTSDGSLKDTEALKKILEHFDIINKDLISIFEKNNIKPIESLNKKLDPNLHQAMMEIEDDNKEAGTIVQEIQKGFTIKNRLLRPSL
VGVSKKKQDNDKKNEENKEKLEKK