Forum "Recherche d'homologues: BLAST"

Thread subject: Une seule séquence homologue

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Une seule séquence homologue
reneejenni
23 Feb 2011 21:03
Non evaluated contribution
Bonjour,

Je voudrais savoir si j'ai bien compri ce qui a été dit en cours. Lorsqu' on soumet notre séquence protéique au Blastp, si nous obtenons au moins une séquence homologue, nous n'avons pas à faire un blastX car celui ci doit se faire seulement en abscence d'homologue.Est-ce exact?

J'obtient une séquence homologue lorsque je fait un blastp contre la banque nr et aucune contre la banque env_nr du coup, que dois je faire?

Cordialement,
Renée et Jennifer
C_Brochier_11
26 Feb 2011 16:13
Game master
Bonjour,

Ce n'est pas tout à fait exact. J'ai pris l'exemple d'un cas où il n'y avait aucun homologue, mais cela s'applique aussi aux cas où vous ne trouvez que quelques homologues.

Céline Brochier