omarissem
13 Feb 2011 20:28
Non evaluated contribution |
bonjour,
mon blastn ne trouve aucun homologue sur les bases de donnée nucléique,par contre le blastp trouve des homologues(base protéique) très très faiblement similaire ce qui me pose un problème de dire si cette sequence est codante ou non. si cette sequence est codante la construction phylogénétique peut-elle être construite avec des séquences homologue faiblement similaire avec ma sequence d\'intérêt?
DONNEE BLASTP
MAX SCORE 52.8 TOTAL SCORE 52.8 QUERY COVERAGE 35% EVALUE 3e-06
merci.
omarissem |
C_Brochier_11
13 Feb 2011 21:27
Game master |
Bonsoir,
La question codant/non condant est liée à la présence d'au moins un ORF (qui ne soit pas un faux positif manifeste) dans votre fragment d'ADN. Donc codant/non codant s'applique à la séquence génomique et non à l'ORF.
Céline Brochier
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