Forum "Recherche d'ORF"

Thread subject: ORF Finder ne trouve ni stop ni start

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ORF Finder ne trouve ni stop ni start
omarissem
7 Feb 2011 16:14
Non evaluated contribution
j'ai utilisé SMS sur ma première séquence nucléotidique et me donne comme résultat la séquence entière en faisa  
C_Brochier_11
7 Feb 2011 16:15
Game master
Il manque la fin de votre message.

Céline Brochier
omarissem
7 Feb 2011 16:21
Non evaluated contribution
j'ai utilisé SMS sur ma première séquence nucléotidique et me donne comme résultat la séquence entière (LA PLUS GRANDE), en faisant un alignement avec la banque de donné nucléique il existe bien une séquence homologue a ma séquence mais plus grande en terme de nucléotide j'en déduit que les codons stop et start ne figure pas sur ma séquence  ,ma question et quelle numéro je dois attribué a chacun des codon start et stop dans la rubrique ORF??    
E_Meglecz_11
7 Feb 2011 16:38
Game master
Bonjour,

Comme tous les nucléotides sont inclus dans votre ORF il est logique de donner la première et la dernière bases de votre séquence. Même si le vrai début et de fin de la partie traduite se trouve avant et après de votre séquence.

Emese Meglecz