MELO
17 Dec 2010 12:00
Non evaluated contribution |
Bonjour
Lorsque nous réalisons l'analyse avec SMS DNA stat nous obtenons un pourcentage en bases A/T supérieur à 70%. cela nous indique donc qu'il y a suffisamment de bases A/T pour faire des codons stop. notre sequence possede un codon stop, comment interpréter ces résultats ? est ce que cela confirme la présence de notre codon stop dans notre ORF ou simplement que ce dernier est fiable |
CHerrmann_10
17 Dec 2010 13:36
Game master |
Bonjour,
si vous avez un très fort taux de A/T dans votre séquence de départ, la fréquence à laquelle vous trouverez purement par hasard un codon stop sera plus élevée: vous trouverez plus fréquemment un codon stop, et les ORF seront typiquement plus petits. Si à l'inverse vous trouvez un grand ORF, alors cela sera d'autant plus significatif, et ce sera le signe que cet ORF est très vraissemblablement codant. |