Anntathon
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Messages Thèmes
17
 General Annotathon issues, using the interface, bugs etc.
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Messages Lecteurs Sujet
20 Apr 2018 8:30 ashru2006 Open Access
1
 17 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:29 ashru2006 Open Access
1
 4 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:24 ashru2006 Open Access
1
 5 Genomic Sequence
22 Feb 2018 20:39 E_Meglecz18 USTH2018
1
 22 closing time: 23:59 28th of February
6 Feb 2017 11:12 trungbui USTH2017
1
 32 Questions about the evaluation 1
31 May 2016 10:53 CamaliaTan PSB2016
2
 60 This sequence TO36D_5877010.1
21 Oct 2012 22:51 staggerwin Open Access
2
 33 Neighboring fragments
14 Apr 2010 16:30 bigecske2 UNIDEB
1
 27 annotálás
9 Jan 2009 21:38 Supervisor Open Access
1
 57 The "Rule book" is updated
5 Jan 2009 20:49 chevalier Open Access
3
 190 Informations de classification taxonomique
83
 ORF finding
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Messages Lecteurs Sujet
27 Jul 2018 11:32 Ryann PSB2018
1
 19 ORF
27 Jul 2018 11:27 Ryann PSB2018
1
 3 ORF
27 Jul 2018 11:11 Ryann PSB2018
1
 3 ORF
27 Jul 2018 9:31 NICSXY PSB2018
1
 3 orf_1
27 Jul 2018 9:25 NICSXY PSB2018
1
 5 ORF finding ORF1
26 Jul 2018 21:35 Jeremylimsy1995 Open Access
1
 3 orf
26 Jul 2018 10:57 riceline PSB2018
1
 5 FASTA FORMAT
26 Jul 2018 10:42 riceline PSB2018
1
 1 FASTA
23 Jul 2018 13:36 shaz PSB2018
1
 17 NO ORF
23 Jul 2018 7:14 Thasheeni PSB2018
1
 19 ORF
27
 Homolog hunting: BLAST
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Messages Lecteurs Sujet
27 Jul 2018 11:36 Ryann PSB2018
1
 7 BLAST Analysis
23 Jul 2018 7:48 Thasheeni PSB2018
1
 12 BLASTp
21 Jul 2018 7:40 Janus PSB2018
1
 24 No significant homology
21 Jul 2018 7:32 Janus PSB2018
1
 16 Only one homologue
21 Jul 2018 7:29 Janus PSB2018
1
 10 No putative protein
21 Jul 2018 7:28 Janus PSB2018
1
 15 Insignificant E-value
21 Jul 2018 7:23 Janus PSB2018
2
 44 E-value too insignificant
19 Jul 2018 12:16 Tessaoh PSB2018
1
 13 No homology
3 Jul 2017 18:39 jiaxin PSB2017
1
 46 New species found
25 Jun 2016 19:28 18575801_SY PSB2016
1
 16 blast
8
 Multiple sequence alignements
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Messages Lecteurs Sujet
27 Jul 2018 11:41 Ryann PSB2018
1
 2 MSA of top 5 sequences
23 Jul 2018 7:08 Thasheeni PSB2018
1
 17 Multiple alignment
28 Apr 2011 8:40 SAS BSB6_spring2011
1
 18 MSA
28 Apr 2011 8:18 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 16 clustalw2
27 Apr 2011 9:52 B_hajra BSB6_spring2011
1
 32 multiple sequence allignment
27 Apr 2011 9:37 B_hajra BSB6_spring2011
1
 13 multiple sequence allignment
18 Apr 2011 9:36 sanafarheen BSB6_spring2011
1
 12 msa :D
18 Apr 2011 9:29 sid_afo BSB6_spring2011
1
 16 multiple sequnce alignmnt
17
 Phylogenetic analysis
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Messages Lecteurs Sujet
25 Jun 2016 19:30 18575801_SY PSB2016
1
 9 Phylogenetic tree
28 Apr 2011 8:21 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 18 tree
27 Apr 2011 10:00 B_hajra BSB6_spring2011
1
 20 tree analysis
18 Apr 2011 9:38 sanafarheen BSB6_spring2011
1
 16 phylogenetic analysis
18 Apr 2011 9:32 sid_afo BSB6_spring2011
1
 13 tree details
19 May 2009 11:17 Maleeha BSB06CIIT
1
 25 annotation
27 Nov 2008 20:14 drhoads Open Access
11
 710 How to get a textual phylogenetic tree?
1
 Ontologies (molecular function & biological process)
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Messages Lecteurs Sujet
25 Jun 2016 19:34 18575801_SY PSB2016
1
 3 ontologies
15
 Conserved domains
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Messages Lecteurs Sujet
24 Jul 2018 9:57 Grace PSB2018
1
 6 no conserved domain and function had been identified
20 Apr 2018 8:15 ashru2006 Open Access
1
 4 INTERPROscan analysis
20 Apr 2018 8:14 ashru2006 Open Access
1
 4 Protein Domains
20 Apr 2018 8:11 ashru2006 Open Access
1
 1 Protein Domains
20 Apr 2018 8:07 ashru2006 Open Access
1
 1 Protein Domains
20 Apr 2018 8:05 ashru2006 Open Access
1
 2 Protein Domains
20 Apr 2018 8:04 ashru2006 Open Access
1
 1 Protein Domains
20 Apr 2018 8:03 ashru2006 Open Access
1
 2 Protein Domains
25 Jun 2016 19:32 18575801_SY PSB2016
1
 6 Conserved domains
25 Jun 2016 10:54 YAPws PSB2016
1
 6 Summary of TO78M_5925010.1
15
 Conclusion
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Messages Lecteurs Sujet
21 Jul 2018 7:38 Janus PSB2018
1
 24 Contains putative protein
22 Jan 2018 4:32 nhminh0701 USTH2018
1
 19 Vai cut
25 Jun 2016 19:35 18575801_SY PSB2016
1
 9 conclusion
24 Jun 2016 17:34 xuejing PSB2016
1
 17 Annotathon report 18601881
24 Jun 2016 17:28 Verniselim PSB2016
1
 7 Conclusion
24 Jun 2016 16:50 18393000 PSB2016
1
 4 TO9D_5914020 Genomic DNA (: Algiers-Barcelona station 9 DCM)
24 Jun 2016 16:38 reggiepsb PSB2016
1
 5 Conclusion on Sequence TO9S_5805010.1
24 Jun 2016 16:25 SiowChen PSB2016
1
 4 >TO68D_5917010 Genomic DNA (: CapeTown-Ascencion station 68 DCM)
24 Jun 2016 16:14 SyawqinaAdlin PSB2016
1
 5 Possible Putative Protein of TO32S_5896010.1
24 Jun 2016 8:40 018548141 PSB2016
1
 12 Blastp findings of the -2, +1 and +3 reading frames of the genomic sequence
538
 Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs
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Messages Lecteurs Sujet
13 Nov 2019 11:40 AQuaiser_19 AME_2019
1
 17 forum within AME_2019 test message
2 Apr 2019 18:44 MAudhui OBI_2019
4
 56 Echéance
31 Mar 2019 23:09 Leacauchois18 L3-PGF-CTES-2018
6
 88 Informations
29 Mar 2019 16:09 LAETITIA L3-PGF-CTES-2018
3
 80 règles de fairplay
12 Feb 2019 12:55 isis L3-PGF-CTES-2018
8
 193 e valeur
7 Feb 2019 16:46 LauraCTES L3-PGF-CTES-2018
11
 301 Absence de codon STOP à la fin d'un ORF
7 Feb 2019 16:37 LauraCTES L3-PGF-CTES-2018
1
 20 Absence de codon STOP à la fin d'un ORF
26 Nov 2018 15:24 riman PGF-2018
2
 44 Aucun commentaire sur ma correction de l'évaluation I
26 Nov 2018 11:08 CPeger13 PGF-2018
4
 55 UE PROGRAMMATION
7 Nov 2018 15:20 CPeger13 PGF-2018
1
 22 Cours
240
 Recherche d'ORF
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Messages Lecteurs Sujet
20 Nov 2019 12:44 anloiret UCA_19_20
1
 37 1ère analyse
23 Oct 2019 12:45 carand0224 UCA_19_20
1
 44 1ère analyse
23 Oct 2019 9:02 Mars UCA_19_20
1
 44 ORFFinder
15 Apr 2019 10:04 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
 45 Choix final
14 Apr 2019 20:40 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
 24 Cas particulier
11 Apr 2019 11:25 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
 25 Nombre à virgule
9 Apr 2019 13:42 sheina L3-PGF-CTES-2018
9
 106 plus explications
9 Apr 2019 13:41 sheina L3-PGF-CTES-2018
1
 12 plus explications
8 Apr 2019 21:56 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
 39 Ai-je bien compris?
8 Apr 2019 15:06 DebB L3-PGF-CTES-2018
2
 21 Message ERROR
521
 Recherche d'homologues: BLAST
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Messages Lecteurs Sujet
24 May 2019 10:29 ramonapojar L3-PGF-CTES-2018
2
 10 vérifier la fiabilité d'une annotation
19 May 2019 14:41 sheina L3-PGF-CTES-2018
4
 26 Fonction de mon ORF
8 May 2019 16:38 isis L3-PGF-CTES-2018
8
 117 valeur seuil
14 Apr 2019 20:50 sheina L3-PGF-CTES-2018
4
 31 Longueur
10 Apr 2019 17:33 HarryTuttle L3-PGF-CTES-2018
3
 34 doute sur le code génétique en revoyant la vidéo sur le BLASTx pour recherche rapide d'homologues
9 Apr 2019 17:54 DebB L3-PGF-CTES-2018
2
 27 Doute dans le choix du groupe d'étude et extérieur
8 Apr 2019 17:06 Leacauchois18 L3-PGF-CTES-2018
5
 55 E value
7 Apr 2019 16:49 DebB L3-PGF-CTES-2018
2
 30 Difficulté à trouver le groupe d'étude et le groupe extérieur
31 Mar 2019 15:15 Jules_Garreau OBI_2019
2
 26 sélélection des groupes d'études et extèrieurs
30 Mar 2019 9:21 Krystel L3-PGF-CTES-2018
6
 120 Forte e-value max impact ? Pourcentage alignement pas terrible
212
 Alignement multiple: CLUSTALW
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Messages Lecteurs Sujet
21 May 2019 20:43 ramonapojar L3-PGF-CTES-2018
3
 27 deux protéines dans le meme ORF ?
10 May 2019 23:12 Krystel L3-PGF-CTES-2018
4
 56 Gaps à l'intérieur de l'alignement
26 Apr 2019 16:57 nicomine Bioch2019
2
 24 Positions conservées et arbres phylogénétique
16 Apr 2019 12:16 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
 24 Déterminer la fonction de l'ORF
15 Apr 2019 22:14 teamNN Bioch2019
2
 37 analyse attendue
4 Apr 2019 22:01 hayafarouz L3-PGF-CTES-2018
7
 118 GROUPE D'etude imprecis mais forte e value
2 Apr 2019 15:03 JulieP L3-PGF-CTES-2018
5
 95 Alignement me semblant mauvais
5 Dec 2018 12:30 cocodmt PGF-2018
3
 64 Incompréhension
10 May 2018 21:56 sania Bioch2018
3
 17 Bug de Gblocks
28 Apr 2018 15:10 MissDia95 Bioch2018
2
 8 Protocole
645
 Analyse phylogénétique
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Messages Lecteurs Sujet
20 Sep 2019 16:15 PHingampMM19 Master-Sciences-Mer
1
 7 Image de l'arbre "Zarbi" de la séquence OMRGCv2_8442080
26 May 2019 16:27 SARAH L3-PGF-CTES-2018
1
 6 RACINE et noeud
24 May 2019 15:08 SARAH L3-PGF-CTES-2018
4
 19 probleme racine
28 Apr 2019 18:41 sheina L3-PGF-CTES-2018
4
 24 Format du texte pour l'arbre
26 Apr 2019 15:04 SARFEL Bioch2019
4
 33 Arbe phylogénique
25 Apr 2019 10:26 Audelia L3-PGF-CTES-2018
2
 20 Choix du groupe d'étude
15 Apr 2019 17:26 DJABER-HOU L3-PGF-CTES-2018
2
 22 les séquences de groupe extérieure dans l'arbre phylogénique
12 Apr 2019 20:37 KareneFunaro L3-PGF-CTES-2018
6
 79 Arbre
12 Apr 2019 19:25 HarryTuttle L3-PGF-CTES-2018
5
 63 Arbre 2: même type de problème que JulieP dans "Arbre"?
12 Apr 2019 17:03 chloegouyet L3-PGF-CTES-2018
4
 59 enracinement
120
 Domaines conservés: INTERPRO
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Messages Lecteurs Sujet
13 Nov 2019 0:08 RLPGF PGF-2019
2
 27 Domaine protéique étrange
9 Feb 2019 21:11 GRA1_Antoine BISM2019
6
 173 Infos à mettre dans le Tableau
4 May 2018 20:59 MissDia95 Bioch2018
2
 15 Les numéros d'IPR à mettre dans la table 2
3 May 2018 20:00 MissDia95 Bioch2018
2
 10 Protocole
29 Apr 2018 18:42 Rosonp Bioch2018
3
 8 GO term
29 Apr 2018 13:41 Rosonp Bioch2018
2
 3 Toujours de GO-terms avec INTERPRO séquence 1
27 Apr 2018 16:50 Rosonp Bioch2018
2
 9 Pas de GO-terms
2 Apr 2017 16:47 ClaraSophie Bioch2017
1
 10 Fiche interpro supprimée
8 Nov 2016 14:57 estana BioCell2016
2
 26 dommaines protéiques
28 Oct 2016 11:25 Laury BioCell2016
2
 31 Pas de domaine conservés retrouvés sur INTERPRO
45
 Fonctions moléculaires & Processus biologiques
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Messages Lecteurs Sujet
21 May 2019 18:52 DebB L3-PGF-CTES-2018
3
 25 Doute sur le groupe d'étude et la séquence analysée
12 May 2018 23:15 MissDia95 Bioch2018
1
 5 Classification de l'ORF
24 Feb 2017 16:24 ClaraSophie Bioch2017
2
 24 Domaine proteique
23 Feb 2017 14:22 Vincent-Marine Bioch2017
3
 34 Choix de la fonction/processus et gène
27 Apr 2015 22:41 FranckLea Bioch2015
7
 93 Détermination du gène
22 Mar 2014 14:04 Tythan AMIG2016
2
 46 Problème de choix de la fonction moléculaire
23 Apr 2012 17:24 quentlude Biochimie 2012
2
 40 Symbole de gène
17 Feb 2011 17:18 BrothTeam Biochimie 2011
3
 51 pas de domaines structuraux sur interpro
16 Feb 2011 20:00 L3CharlotteAure Biochimie 2011
4
 129 Fonctions moléculaires, processus biologiques et taxonomie
17 Dec 2010 18:04 MELO BioCell2010
2
 48 Processus Biologique
46
 Conclusion
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Messages Lecteurs Sujet
19 May 2019 19:53 sheina L3-PGF-CTES-2018
3
 25 Rickettsiales intruses
7 May 2019 14:25 LAETITIA L3-PGF-CTES-2018
2
 40 manque de place / citation des sources
16 Apr 2019 0:06 DJABER-HOU L3-PGF-CTES-2018
5
 93 Soumision Annotation a l'evaluation
9 Dec 2018 11:54 ChloeB OBEM-2018
3
 47 Pdf
9 May 2015 19:14 LaurieNoemie Bioch2015
1
 13 Nombre de caractère limites de la conclusion
8 May 2015 16:09 FranckLea Bioch2015
2
 27 Poids moléculaire
27 Nov 2012 16:37 matou BioCell2012
1
 49 Oubli du code [A CORRIGER]
19 Apr 2012 10:16 Stellathan Biochimie 2012
2
 35 Symbole de gènes
3 Sep 2009 15:39 Hingamp BioCell 2005
9
 59 test: ignorez SVP
26 Apr 2008 21:25 BNPA Biochimie 2008
1
 24 notation et remarque