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17
General Annotathon issues, using the interface, bugs etc.
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Sujet
20 Apr 2018 8:30
ashru2006
Open Access
1
38
Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:29
ashru2006
Open Access
1
11
Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:24
ashru2006
Open Access
1
9
Genomic Sequence
22 Feb 2018 20:39
E_Meglecz18
USTH2018
1
27
closing time: 23:59 28th of February
6 Feb 2017 11:12
trungbui
USTH2017
1
39
Questions about the evaluation 1
31 May 2016 10:53
CamaliaTan
PSB2016
2
74
This sequence TO36D_5877010.1
21 Oct 2012 22:51
staggerwin
Open Access
2
43
Neighboring fragments
14 Apr 2010 16:30
bigecske2
UNIDEB
1
28
annotálás
9 Jan 2009 21:38
Supervisor
Open Access
1
61
The "Rule book" is updated
5 Jan 2009 20:49
chevalier
Open Access
3
230
Informations de classification taxonomique
83
ORF finding
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Sujet
27 Jul 2018 11:32
Ryann
PSB2018
1
43
ORF
27 Jul 2018 11:27
Ryann
PSB2018
1
12
ORF
27 Jul 2018 11:11
Ryann
PSB2018
1
10
ORF
27 Jul 2018 9:31
NICSXY
PSB2018
1
11
orf_1
27 Jul 2018 9:25
NICSXY
PSB2018
1
14
ORF finding ORF1
26 Jul 2018 21:35
Jeremylimsy1995
Open Access
1
7
orf
26 Jul 2018 10:57
riceline
PSB2018
1
9
FASTA FORMAT
26 Jul 2018 10:42
riceline
PSB2018
1
2
FASTA
23 Jul 2018 13:36
shaz
PSB2018
1
20
NO ORF
23 Jul 2018 7:14
Thasheeni
PSB2018
1
25
ORF
27
Homolog hunting: BLAST
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Sujet
27 Jul 2018 11:36
Ryann
PSB2018
1
28
BLAST Analysis
23 Jul 2018 7:48
Thasheeni
PSB2018
1
23
BLASTp
21 Jul 2018 7:40
Janus
PSB2018
1
31
No significant homology
21 Jul 2018 7:32
Janus
PSB2018
1
19
Only one homologue
21 Jul 2018 7:29
Janus
PSB2018
1
14
No putative protein
21 Jul 2018 7:28
Janus
PSB2018
1
20
Insignificant E-value
21 Jul 2018 7:23
Janus
PSB2018
2
56
E-value too insignificant
19 Jul 2018 12:16
Tessaoh
PSB2018
1
18
No homology
3 Jul 2017 18:39
jiaxin
PSB2017
1
50
New species found
25 Jun 2016 19:28
18575801_SY
PSB2016
1
25
blast
8
Multiple sequence alignements
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Sujet
27 Jul 2018 11:41
Ryann
PSB2018
1
8
MSA of top 5 sequences
23 Jul 2018 7:08
Thasheeni
PSB2018
1
33
Multiple alignment
28 Apr 2011 8:40
SAS
BSB6_spring2011
1
22
MSA
28 Apr 2011 8:18
HiraEjaz
BSB6_spring2011
1
22
clustalw2
27 Apr 2011 9:52
B_hajra
BSB6_spring2011
1
48
multiple sequence allignment
27 Apr 2011 9:37
B_hajra
BSB6_spring2011
1
18
multiple sequence allignment
18 Apr 2011 9:36
sanafarheen
BSB6_spring2011
1
16
msa :D
18 Apr 2011 9:29
sid_afo
BSB6_spring2011
1
23
multiple sequnce alignmnt
17
Phylogenetic analysis
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Sujet
25 Jun 2016 19:30
18575801_SY
PSB2016
1
29
Phylogenetic tree
28 Apr 2011 8:21
HiraEjaz
BSB6_spring2011
1
27
tree
27 Apr 2011 10:00
B_hajra
BSB6_spring2011
1
30
tree analysis
18 Apr 2011 9:38
sanafarheen
BSB6_spring2011
1
28
phylogenetic analysis
18 Apr 2011 9:32
sid_afo
BSB6_spring2011
1
22
tree details
19 May 2009 11:17
Maleeha
BSB06CIIT
1
28
annotation
27 Nov 2008 20:14
drhoads
Open Access
11
899
How to get a textual phylogenetic tree?
1
Ontologies (molecular function & biological process)
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Sujet
25 Jun 2016 19:34
18575801_SY
PSB2016
1
8
ontologies
15
Conserved domains
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Sujet
24 Jul 2018 9:57
Grace
PSB2018
1
14
no conserved domain and function had been identified
20 Apr 2018 8:15
ashru2006
Open Access
1
15
INTERPROscan analysis
20 Apr 2018 8:14
ashru2006
Open Access
1
11
Protein Domains
20 Apr 2018 8:11
ashru2006
Open Access
1
6
Protein Domains
20 Apr 2018 8:07
ashru2006
Open Access
1
4
Protein Domains
20 Apr 2018 8:05
ashru2006
Open Access
1
3
Protein Domains
20 Apr 2018 8:04
ashru2006
Open Access
1
4
Protein Domains
20 Apr 2018 8:03
ashru2006
Open Access
1
5
Protein Domains
25 Jun 2016 19:32
18575801_SY
PSB2016
1
13
Conserved domains
25 Jun 2016 10:54
YAPws
PSB2016
1
8
Summary of TO78M_5925010.1
15
Conclusion
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Sujet
21 Jul 2018 7:38
Janus
PSB2018
1
25
Contains putative protein
22 Jan 2018 4:32
nhminh0701
USTH2018
1
20
Vai cut
25 Jun 2016 19:35
18575801_SY
PSB2016
1
16
conclusion
24 Jun 2016 17:34
xuejing
PSB2016
1
18
Annotathon report 18601881
24 Jun 2016 17:28
Verniselim
PSB2016
1
14
Conclusion
24 Jun 2016 16:50
18393000
PSB2016
1
5
TO9D_5914020 Genomic DNA (: Algiers-Barcelona station 9 DCM)
24 Jun 2016 16:38
reggiepsb
PSB2016
1
12
Conclusion on Sequence TO9S_5805010.1
24 Jun 2016 16:25
SiowChen
PSB2016
1
4
>TO68D_5917010 Genomic DNA (: CapeTown-Ascencion station 68 DCM)
24 Jun 2016 16:14
SyawqinaAdlin
PSB2016
1
7
Possible Putative Protein of TO32S_5896010.1
24 Jun 2016 8:40
018548141
PSB2016
1
13
Blastp findings of the -2, +1 and +3 reading frames of the genomic sequence
629
Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs
[Tous les sujets]
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Sujet
21 Feb 2023 21:37
marieb
L3-PGF-CTES-2023
3
33
ouvrir 2 pages d'annotation
9 Feb 2023 19:36
marieb
L3-PGF-CTES-2023
2
30
erreur
24 Nov 2022 10:51
AugustinF
L3-PGF-2022
1
10
Oral de Bioinformatique
23 Nov 2022 13:16
bouillard
L3-PGF-2022
2
24
pip
28 Sep 2022 18:52
bouillard
L3-PGF-2022
3
47
recherche sequence
21 Apr 2022 14:07
Ma93
L3-PGF-CTES-2021
4
56
choix du groupe d'étude
14 Apr 2022 9:10
Laurence
L3-PGF-CTES-2021
2
33
soumission séquence - passage de Annotation I à Corrrection I
17 Mar 2022 12:29
test_2022
Bioch2022
1
21
Test
17 Mar 2022 12:24
B_Wirth_22
Bioch2022
2
19
Test
14 Mar 2022 17:09
MarinePapot
L3-PGF-CTES-2021
7
125
NCBI Blast : bouton Reformat, autre option?
428
Recherche d'ORF
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Sujet
12 Mar 2023 19:35
noapardo
L3-PGF-CTES-2023
4
20
Choix d'ORF
27 Feb 2023 18:33
noapardo
L3-PGF-CTES-2023
2
20
Determiner les ORF individuellement
21 Feb 2023 19:24
retenodus
L3-PGF-CTES-2023
3
34
ORF non complet / classification
30 Jan 2023 10:27
Veronica
L3-PGF-CTES-2023
3
39
ORFs sans homologue sur Swiss Prot
30 Jan 2023 10:18
Veronica
L3-PGF-CTES-2023
3
48
Choix ORFs
16 Oct 2022 19:47
Lesboss
BioCell2022
1
42
diagramme orf
5 Oct 2022 15:17
LILYROSEPGF
L3-PGF-2022
2
36
Gènes absents
15 Apr 2022 15:43
miyuka
Bioch2022
4
36
Choix de l'ORF KNOWN
14 Apr 2022 15:34
AshleyRusso
L3-PGF-CTES-2021
2
29
ORF codant ? Pertinent pour annotation ?
11 Apr 2022 15:32
Dvo26
L3-PGF-CTES-2021
3
45
choix de l'ORF
725
Recherche d'homologues: BLAST
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Sujet
14 Mar 2023 11:02
Sundance
L3-PGF-CTES-2023
2
14
E-valeur=0
13 Mar 2023 22:06
noapardo
L3-PGF-CTES-2023
11
63
"Definition List"
2 Mar 2023 19:23
noapardo
L3-PGF-CTES-2023
1
8
Proteines hypothetiques
2 Mar 2023 19:21
noapardo
L3-PGF-CTES-2023
6
42
Proteines hypothetiques
2 Mar 2023 19:16
noapardo
L3-PGF-CTES-2023
3
21
Aucune similarites trouvees
2 Mar 2023 17:19
marieb
L3-PGF-CTES-2023
2
14
e value 0
22 Feb 2023 12:19
Eva_f
L3-PGF-CTES-2023
2
16
% identité différent sur un même ORF
20 Feb 2023 8:50
marieb
L3-PGF-CTES-2023
4
33
choix de la séquence
27 Oct 2022 9:08
masantiago
UCA_22_23
1
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Bioinfo
24 Apr 2022 19:14
PLQE
Bioch2022
2
31
Comment connaitre la e-value seuil ?
329
Alignement multiple: CLUSTALW
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Sujet
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AMIRA
L3-PGF-CTES-2023
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AMIRA
L3-PGF-CTES-2023
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ivan-fay
L3-PGF-CTES-2023
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LEVY
L3-PGF-CTES-2023
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B_Wirth_22
Bioch2022
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SofiaOuarriche
L3-PGF-CTES-2021
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soleneA
L3-PGF-CTES-2021
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Anna
L3-PGF-CTES-2021
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MaeBinaud
L3-PGF-CTES-2021
4
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1 Apr 2022 17:13
maellejarnoux
L3-PGF-CTES-2021
5
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Sujet
16 Mar 2023 9:30
ivan-fay
L3-PGF-CTES-2023
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L3-PGF-CTES-2023
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9 Mar 2023 10:08
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L3-PGF-CTES-2023
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retenodus
L3-PGF-CTES-2023
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L3-PGF-CTES-2023
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ivan-fay
L3-PGF-CTES-2023
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Philippe
L3-PGF-CTES-2023
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Anissa
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SofiaOuarriche
L3-PGF-CTES-2021
2
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152
Domaines conservés: INTERPRO
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Sujet
24 Nov 2022 15:00
LesPerdus
BioCell2022
1
27
Petit problème sur la recherche de domaines protéiques INTERPRO
1 May 2022 17:41
SRSM
Bioch2022
2
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Choix du domaine
11 Apr 2022 23:00
Sylia
Bioch2022
3
36
Domaine protéique non conservé dans la famille
26 Mar 2022 12:10
mongeoussada
Bioch2022
2
30
Choix du domaine retenu
13 Oct 2021 20:01
ilonaMi
Master-Mer-2021
3
32
Choix du profil Interpro pour table 2
13 Oct 2021 19:57
ilonaMi
Master-Mer-2021
1
7
Choix du profil Interpro pour table 2
13 Oct 2021 19:56
ilonaMi
Master-Mer-2021
1
8
Choix du profil Interpro pour table 2
4 Oct 2021 18:16
emmaRO
Master-Mer-2021
2
29
Domaines protéiques à annoter
27 Sep 2021 17:42
Thibault_A
Master-Mer-2021
2
32
Domaines protéiques INTERPRO
20 Sep 2021 11:15
ilonaMi
Master-Mer-2021
2
30
Base de données
50
Fonctions moléculaires & Processus biologiques
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Sujet
29 Apr 2022 11:21
Faiznaleann
Bioch2022
4
31
Contradiction
28 Apr 2022 10:37
B_Wirth_22
Bioch2022
1
11
Choix du Processus biologique
21 May 2019 18:52
DebB
L3-PGF-CTES-2018
3
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Doute sur le groupe d'étude et la séquence analysée
12 May 2018 23:15
MissDia95
Bioch2018
1
13
Classification de l'ORF
24 Feb 2017 16:24
ClaraSophie
Bioch2017
2
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Domaine proteique
23 Feb 2017 14:22
Vincent-Marine
Bioch2017
3
64
Choix de la fonction/processus et gène
27 Apr 2015 22:41
FranckLea
Bioch2015
7
136
Détermination du gène
22 Mar 2014 14:04
Tythan
AMIG2016
2
54
Problème de choix de la fonction moléculaire
23 Apr 2012 17:24
quentlude
Biochimie 2012
2
65
Symbole de gène
17 Feb 2011 17:18
BrothTeam
Biochimie 2011
3
66
pas de domaines structuraux sur interpro
121
Conclusion
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Sujet
12 Oct 2022 12:16
IMalki
L3-PGF-2022
1
17
Pour sars Cov 1
28 Sep 2022 14:18
LILYROSEPGF
L3-PGF-2022
1
18
J'ai trouvé des nouveaux génomes + génome privé
27 Sep 2022 17:48
P_Hingamp_PGF22
L3-PGF-2022
1
12
Paru hier : article "Origine du SARS-CoV-2 et du Covid-19 : le point sur l’enquête en cours et les dernières hypothèses"
26 Sep 2022 18:51
P_Hingamp_PGF22
L3-PGF-2022
1
11
Le virus qui venait du froid...
23 Sep 2022 10:38
hoda1
L3-PGF-2022
1
21
J'ai trouvé le génome complet de la souche BANAL-20-52/Laos/2020 identifiée par l'Institut Pasteur
22 Sep 2022 20:27
LILYROSEPGF
L3-PGF-2022
1
20
J'ai trouvé le génome complet de SARS-Cov1 (Souche Tor2)
22 Sep 2022 20:18
LILYROSEPGF
L3-PGF-2022
1
18
J'ai trouvé le génome complet de SARS-Cov2 - Wuhan-Hu-1
22 Sep 2022 17:41
P_Hingamp_PGF22
L3-PGF-2022
2
20
Max une séquence de référence par étudiant :) Et d'autres séquences de références sont les bienvenues
22 Sep 2022 17:38
chamcham
L3-PGF-2022
1
20
J'ai trouvé le génome du MERS
22 Sep 2022 17:35
IMalki
L3-PGF-2022
1
19
j'ai trouvé le genome du Sars-CoV 2