Anntathon
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Messages Thèmes
13
 General Annotathon issues, using the interface, bugs etc.
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Messages Lecteurs Sujet
6 Feb 2017 11:12 trungbui USTH2017
1
 22 Questions about the evaluation 1
31 May 2016 10:53 CamaliaTan PSB2016
2
 47 This sequence TO36D_5877010.1
21 Oct 2012 22:51 staggerwin Open Access
2
 27 Neighboring fragments
14 Apr 2010 16:30 bigecske2 UNIDEB
1
 27 annotálás
9 Jan 2009 21:38 Supervisor Open Access
1
 56 The "Rule book" is updated
5 Jan 2009 20:49 chevalier Open Access
3
 172 Informations de classification taxonomique
12 Dec 2008 19:14 Supervisor Open Access
1
 56 The Frequently Asked Questions (FAQ) version 1 is complete
17 Oct 2008 17:29 Pascal_Hingamp UNAM
1
 38 New domain annotation fields, and other minor changes
11 Oct 2008 20:30 Pascal_Hingamp UNAM
1
 33 Error in "Adding a sequence to cart" is mended
65
 ORF finding
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Messages Lecteurs Sujet
1 Mar 2017 0:44 Ccile Open Access
1
 6 Known vs Novel
25 Jun 2016 19:29 18575801_SY PSB2016
1
 7 orf
24 Jun 2016 21:04 CamaliaTan PSB2016
1
 8 TO36D_5877010.1 by Camalia Tan Hui Ci
24 Jun 2016 17:54 1859394011 PSB2016
1
 4 TO41D_5887010.1
24 Jun 2016 17:47 185707260 PSB2016
1
 5 Summary of TO25D_5888010.1
24 Jun 2016 17:29 Verniselim PSB2016
1
 5 Orf findings
24 Jun 2016 16:48 DiyanaAtira PSB2016
1
 6 ORF Finding TO9D_5892010.2
24 Jun 2016 8:39 nurulsakinah PSB2016
1
 11 Orf findings
22 Jun 2016 14:49 enxinandjoey PSB2016
1
 19 Complete strand
15 Jun 2016 22:14 Caristan PSB2016
1
 28 ORF findings
18
 Homolog hunting: BLAST
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Messages Lecteurs Sujet
3 Jul 2017 18:39 jiaxin PSB2017
1
 42 New species found
25 Jun 2016 19:28 18575801_SY PSB2016
1
 8 blast
28 Apr 2011 16:39 SAM BSB6_spring2011
1
 28 blast result
28 Apr 2011 15:17 Rabail BSB6_spring2011
1
 11 BLAST!
28 Apr 2011 8:26 SAS BSB6_spring2011
1
 8 BLAST Results
28 Apr 2011 8:11 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 6 Blast results
27 Apr 2011 9:27 B_hajra BSB6_spring2011
1
 3 blast results
18 Apr 2011 9:50 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 5 Blast result
18 Apr 2011 9:48 BERA_HAJU BSB6_spring2011
1
 2 No hits found
18 Apr 2011 9:43 farahanum BSB6_spring2011
1
 7 BLAST results
6
 Multiple sequence alignements
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Messages Lecteurs Sujet
28 Apr 2011 8:40 SAS BSB6_spring2011
1
 9 MSA
28 Apr 2011 8:18 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 10 clustalw2
27 Apr 2011 9:52 B_hajra BSB6_spring2011
1
 18 multiple sequence allignment
27 Apr 2011 9:37 B_hajra BSB6_spring2011
1
 9 multiple sequence allignment
18 Apr 2011 9:36 sanafarheen BSB6_spring2011
1
 9 msa :D
18 Apr 2011 9:29 sid_afo BSB6_spring2011
1
 8 multiple sequnce alignmnt
17
 Phylogenetic analysis
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Messages Lecteurs Sujet
25 Jun 2016 19:30 18575801_SY PSB2016
1
 2 Phylogenetic tree
28 Apr 2011 8:21 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 13 tree
27 Apr 2011 10:00 B_hajra BSB6_spring2011
1
 18 tree analysis
18 Apr 2011 9:38 sanafarheen BSB6_spring2011
1
 14 phylogenetic analysis
18 Apr 2011 9:32 sid_afo BSB6_spring2011
1
 11 tree details
19 May 2009 11:17 Maleeha BSB06CIIT
1
 22 annotation
27 Nov 2008 20:14 drhoads Open Access
11
 649 How to get a textual phylogenetic tree?
1
 Ontologies (molecular function & biological process)
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Messages Lecteurs Sujet
25 Jun 2016 19:34 18575801_SY PSB2016
1
 1 ontologies
7
 Conserved domains
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Messages Lecteurs Sujet
25 Jun 2016 19:32 18575801_SY PSB2016
1
 4 Conserved domains
25 Jun 2016 10:54 YAPws PSB2016
1
 4 Summary of TO78M_5925010.1
28 Apr 2011 17:21 SAM BSB6_spring2011
1
 15 conserved protein domains
28 Apr 2011 8:25 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 7 interpro
27 Apr 2011 9:57 B_hajra BSB6_spring2011
1
 13 interpro results
8 Jan 2009 18:53 biologiste Open Access
2
 94 résultats brutes
13
 Conclusion
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Messages Lecteurs Sujet
25 Jun 2016 19:35 18575801_SY PSB2016
1
 3 conclusion
24 Jun 2016 17:34 xuejing PSB2016
1
 11 Annotathon report 18601881
24 Jun 2016 17:28 Verniselim PSB2016
1
 3 Conclusion
24 Jun 2016 16:50 18393000 PSB2016
1
 3 TO9D_5914020 Genomic DNA (: Algiers-Barcelona station 9 DCM)
24 Jun 2016 16:38 reggiepsb PSB2016
1
 3 Conclusion on Sequence TO9S_5805010.1
24 Jun 2016 16:25 SiowChen PSB2016
1
 4 >TO68D_5917010 Genomic DNA (: CapeTown-Ascencion station 68 DCM)
24 Jun 2016 16:14 SyawqinaAdlin PSB2016
1
 4 Possible Putative Protein of TO32S_5896010.1
24 Jun 2016 8:40 018548141 PSB2016
1
 9 Blastp findings of the -2, +1 and +3 reading frames of the genomic sequence
30 Apr 2015 12:49 Rebecca LaTrobe2015
1
 28 Trk Protein
30 Apr 2011 22:30 Adil BSB6_spring2011
1
 8 Message
490
 Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs
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Messages Lecteurs Sujet
19 Jun 2017 13:18 Vincent-Marine Bioch2017
1
 3 Demande détail des notes de TP
25 Apr 2017 12:37 A_Quaiser_17 OBI_L2_2017
1
 12 soumission pour evaluation
3 Feb 2017 18:36 Vincent-Marine Bioch2017
2
 22 Problème avec TaxReport
5 Jan 2017 14:31 Laury BioCell2016
2
 24 Relance Oubli Soumission Correction 2
22 May 2016 21:02 FatouManon Clermont_2016
1
 46 Erreur Soumission de projet
5 Feb 2016 18:12 P_Hingamp_16 Bioch2016
16
 512 Questions (et réponses) sur les annotations
18 Dec 2015 13:19 P_Hingamp_15 BioCell2015
1
 23 Examen de bioinformatique
8 Dec 2015 22:01 P_Hingamp_15 BioCell2015
1
 13 Date limite pour la soumission des annotations 2 (finales) de la première séquence repoussée au 18/12
12 Oct 2015 19:24 BigBrother BioCell2015
1
 61 test
15 May 2015 12:03 Chabia Bioch2015
1
 9 Examen écrit
191
 Recherche d'ORF
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Messages Lecteurs Sujet
14 May 2017 19:19 ClaraSophie Bioch2017
2
 10 Cours Annotation Génome
28 Feb 2017 13:56 lasserve_aitou UCA_2016
1
 67 ORF FINDER
31 Jan 2017 16:19 ClaraSophie Bioch2017
3
 28 Search of ORF
3 Nov 2016 11:53 Bio3 BioCell2016
4
 60 2 OFR avec des homologues
18 Nov 2015 14:46 lun BioCell2015
2
 25 problème d'ORF
24 Oct 2015 14:53 JuSzLuCi BioCell2015
4
 69 ORF en sens indirecte prennant la totalité de la séquence.
10 Apr 2015 19:45 M_LIinot OBI
3
 42 ORF bizares ;)
30 Mar 2015 18:05 tuxx Bioch2015
1
 11 Question
5 Nov 2014 17:38 genouxcagneux BioCell2014
2
 30 Recherche d'ORF avec atg, gtg, ctg, ttg
5 Oct 2014 9:38 MarvinOstagh BioCell2014
2
 66 choix de L'ORF
447
 Recherche d'homologues: BLAST
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Messages Lecteurs Sujet
21 Apr 2017 11:31 Vincent-Marine Bioch2017
5
 30 Rapport taxonomique
10 Apr 2017 20:20 Alccio Bioch2017
8
 56 E-valeur seuil
2 Apr 2017 12:44 Yasmine_Alexey Bioch2017
3
 15 Comment c'est possible?
4 Jan 2017 9:30 WaitndSee BIOINFO@LYON_2017-2018
1
 16 Significant alignments
8 Nov 2016 15:34 Laury BioCell2016
2
 31 E value seuil et homologue distant
3 Feb 2016 21:35 AngB_HuaR AMIG2016
2
 25 Choix de la e-value seuil
28 Jan 2016 13:47 P_Hingamp_16 Bioch2016
2
 24 Abandon de l'annotation des séquences qui sont >95% identiques
3 Nov 2015 16:48 Pilgrim BioCell2015
5
 122 Choix d'une e-value seuil
28 Oct 2015 15:38 RosnetRosellini BioCell2015
6
 97 2 Blast très intéressant pour 2 ORF
5 May 2015 11:11 LaurieNoemie Bioch2015
2
 25 Recherche de la valeur seuil
178
 Alignement multiple: CLUSTALW
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Messages Lecteurs Sujet
14 May 2017 15:16 ClaraSophie Bioch2017
4
 28 Faute dans le cours matrice de programmation dynamique. Chapitre 2
30 Mar 2017 13:50 Vincent-Marine Bioch2017
2
 10 Problème de format
28 Oct 2016 15:07 estana BioCell2016
2
 30 groupe extérieur/ étude
9 Dec 2015 19:18 Pilgrim BioCell2015
2
 16 Erreur d'annotation pour la séquence avec le meilleur alignement
5 Dec 2015 11:49 JuSzLuCi BioCell2015
2
 27 Pertes de positions conservés
4 Dec 2014 8:40 ELPO BioCell2014
2
 23 Problème d'alignement avec les choix des groupes
4 Nov 2014 20:55 ioanaetlobna BioCell2014
2
 30 problème au niveau de l'alignement multiple
31 Oct 2014 15:28 SoulaNin BioCell2014
2
 39 Alignement multiple avec GBlocks
21 May 2012 16:14 Bonaiti Biochimie 2012
3
 36 error alignement multiple
15 May 2012 9:35 gpe2-roche Biochimie 2012
2
 23 Dans le cas d'un second arbre...
519
 Analyse phylogénétique
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Messages Lecteurs Sujet
16 Apr 2017 18:39 ClaraSophie Bioch2017
2
 12 séquences eucaryotes
29 Mar 2017 9:23 Vincent-Marine Bioch2017
2
 10 Re enracinement de l'arbre (issus de la matrice de distance)
23 Feb 2017 10:56 Vincent-Marine Bioch2017
6
 48 Re enracinement de l'arbre (issus de la matrice de distance)
7 Nov 2016 15:26 SBDA BioCell2016
2
 36 AU SECOURS, URGENT!
31 Oct 2016 10:54 voyagel3 BioCell2016
2
 28 Hypothèse des événements évolutifs d'une espèce: DA ou HTG?
4 Oct 2016 18:06 P_Hingamp_BC16 BioCell2016
1
 26 Si vous observez des arbres "tous mélangés"...
29 Sep 2016 14:58 zbrrrrra BioCell2016
2
 37 détermination du groupe d'étude et extérieur
24 Sep 2016 16:38 Nico-Sosso BioCell2016
2
 47 Choix du groupe extérieur
16 Dec 2015 0:17 Pilgrim BioCell2015
3
 28 Conclusion sur la provenance de notre ORF
2 May 2015 18:50 FranckLea Bioch2015
2
 18 Topologie de l'arbre
101
 Domaines conservés: INTERPRO
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2 Apr 2017 16:47 ClaraSophie Bioch2017
1
 7 Fiche interpro supprimée
8 Nov 2016 14:57 estana BioCell2016
2
 16 dommaines protéiques
28 Oct 2016 11:25 Laury BioCell2016
2
 17 Pas de domaine conservés retrouvés sur INTERPRO
10 May 2015 13:37 IrigarayA Bioch2015
1
 8 Présentation tableau InterPro
5 May 2015 0:43 IrigarayA Bioch2015
2
 13 Regroupement de domaines
22 Apr 2015 12:54 M_LIinot OBI
2
 18 aa size
18 Dec 2014 15:30 SoulaNin BioCell2014
2
 16 Fonctionnement d'Interpro
21 Nov 2014 14:02 LB-MN BioCell2014
2
 20 Incompréhension d'une remarque
28 Oct 2014 16:28 Ali_Attaf BioCell2014
2
 35 pas d'IPR
18 Feb 2012 14:37 imane-hafsoi Biochimie 2012
3
 99 Choix de domaine protéique
41
 Fonctions moléculaires & Processus biologiques
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Messages Lecteurs Sujet
24 Feb 2017 16:24 ClaraSophie Bioch2017
2
 14 Domaine proteique
23 Feb 2017 14:22 Vincent-Marine Bioch2017
3
 21 Choix de la fonction/processus et gène
27 Apr 2015 22:41 FranckLea Bioch2015
7
 58 Détermination du gène
22 Mar 2014 14:04 Tythan AMIG2016
2
 46 Problème de choix de la fonction moléculaire
23 Apr 2012 17:24 quentlude Biochimie 2012
2
 34 Symbole de gène
17 Feb 2011 17:18 BrothTeam Biochimie 2011
3
 51 pas de domaines structuraux sur interpro
16 Feb 2011 20:00 L3CharlotteAure Biochimie 2011
4
 121 Fonctions moléculaires, processus biologiques et taxonomie
17 Dec 2010 18:04 MELO BioCell2010
2
 46 Processus Biologique
21 Apr 2010 10:12 oralblandine Biochimie 2010
2
 31 détermination de la fonction et du processus
18 Apr 2010 21:10 oralblandine Biochimie 2010
2
 32 problème dans la détermination de la fonctions moléculaire et du processus biologique
33
 Conclusion
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Messages Lecteurs Sujet
9 May 2015 19:14 LaurieNoemie Bioch2015
1
 8 Nombre de caractère limites de la conclusion
8 May 2015 16:09 FranckLea Bioch2015
2
 20 Poids moléculaire
27 Nov 2012 16:37 matou BioCell2012
1
 47 Oubli du code [A CORRIGER]
19 Apr 2012 10:16 Stellathan Biochimie 2012
2
 27 Symbole de gènes
3 Sep 2009 15:39 Hingamp BioCell 2005
9
 50 test: ignorez SVP
26 Apr 2008 21:25 BNPA Biochimie 2008
1
 19 notation et remarque
21 Apr 2008 23:54 bloublou Biochimie 2008
2
 48 problème d'interprétation d'une correction
21 Apr 2008 21:16 noura Biochimie 2008
3
 149 correction
14 Apr 2008 12:02 BNPA Biochimie 2008
1
 26 correction conclusion
14 Apr 2008 10:07 BNPA Biochimie 2008
1
 18 correction conclusion