Anntathon
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Messages Thèmes
17
 General Annotathon issues, using the interface, bugs etc.
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Messages Lecteurs Sujet
20 Apr 2018 8:30 ashru2006 Open Access
1
 7 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:29 ashru2006 Open Access
1
 1 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:24 ashru2006 Open Access
1
 2 Genomic Sequence
22 Feb 2018 20:39 E_Meglecz18 USTH2018
1
 21 closing time: 23:59 28th of February
6 Feb 2017 11:12 trungbui USTH2017
1
 28 Questions about the evaluation 1
31 May 2016 10:53 CamaliaTan PSB2016
2
 53 This sequence TO36D_5877010.1
21 Oct 2012 22:51 staggerwin Open Access
2
 27 Neighboring fragments
14 Apr 2010 16:30 bigecske2 UNIDEB
1
 27 annotálás
9 Jan 2009 21:38 Supervisor Open Access
1
 56 The "Rule book" is updated
5 Jan 2009 20:49 chevalier Open Access
3
 178 Informations de classification taxonomique
83
 ORF finding
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Messages Lecteurs Sujet
27 Jul 2018 11:32 Ryann PSB2018
1
 6 ORF
27 Jul 2018 11:27 Ryann PSB2018
1
 0 ORF
27 Jul 2018 11:11 Ryann PSB2018
1
 1 ORF
27 Jul 2018 9:31 NICSXY PSB2018
1
 1 orf_1
27 Jul 2018 9:25 NICSXY PSB2018
1
 3 ORF finding ORF1
26 Jul 2018 21:35 Jeremylimsy1995 Open Access
1
 1 orf
26 Jul 2018 10:57 riceline PSB2018
1
 5 FASTA FORMAT
26 Jul 2018 10:42 riceline PSB2018
1
 1 FASTA
23 Jul 2018 13:36 shaz PSB2018
1
 16 NO ORF
23 Jul 2018 7:14 Thasheeni PSB2018
1
 15 ORF
27
 Homolog hunting: BLAST
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Messages Lecteurs Sujet
27 Jul 2018 11:36 Ryann PSB2018
1
 1 BLAST Analysis
23 Jul 2018 7:48 Thasheeni PSB2018
1
 8 BLASTp
21 Jul 2018 7:40 Janus PSB2018
1
 20 No significant homology
21 Jul 2018 7:32 Janus PSB2018
1
 13 Only one homologue
21 Jul 2018 7:29 Janus PSB2018
1
 8 No putative protein
21 Jul 2018 7:28 Janus PSB2018
1
 12 Insignificant E-value
21 Jul 2018 7:23 Janus PSB2018
2
 42 E-value too insignificant
19 Jul 2018 12:16 Tessaoh PSB2018
1
 13 No homology
3 Jul 2017 18:39 jiaxin PSB2017
1
 45 New species found
25 Jun 2016 19:28 18575801_SY PSB2016
1
 11 blast
8
 Multiple sequence alignements
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Messages Lecteurs Sujet
27 Jul 2018 11:41 Ryann PSB2018
1
 1 MSA of top 5 sequences
23 Jul 2018 7:08 Thasheeni PSB2018
1
 9 Multiple alignment
28 Apr 2011 8:40 SAS BSB6_spring2011
1
 15 MSA
28 Apr 2011 8:18 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 14 clustalw2
27 Apr 2011 9:52 B_hajra BSB6_spring2011
1
 24 multiple sequence allignment
27 Apr 2011 9:37 B_hajra BSB6_spring2011
1
 10 multiple sequence allignment
18 Apr 2011 9:36 sanafarheen BSB6_spring2011
1
 11 msa :D
18 Apr 2011 9:29 sid_afo BSB6_spring2011
1
 11 multiple sequnce alignmnt
17
 Phylogenetic analysis
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Messages Lecteurs Sujet
25 Jun 2016 19:30 18575801_SY PSB2016
1
 6 Phylogenetic tree
28 Apr 2011 8:21 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 15 tree
27 Apr 2011 10:00 B_hajra BSB6_spring2011
1
 19 tree analysis
18 Apr 2011 9:38 sanafarheen BSB6_spring2011
1
 15 phylogenetic analysis
18 Apr 2011 9:32 sid_afo BSB6_spring2011
1
 11 tree details
19 May 2009 11:17 Maleeha BSB06CIIT
1
 24 annotation
27 Nov 2008 20:14 drhoads Open Access
11
 674 How to get a textual phylogenetic tree?
1
 Ontologies (molecular function & biological process)
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Messages Lecteurs Sujet
25 Jun 2016 19:34 18575801_SY PSB2016
1
 2 ontologies
15
 Conserved domains
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Messages Lecteurs Sujet
24 Jul 2018 9:57 Grace PSB2018
1
 3 no conserved domain and function had been identified
20 Apr 2018 8:15 ashru2006 Open Access
1
 1 INTERPROscan analysis
20 Apr 2018 8:14 ashru2006 Open Access
1
 2 Protein Domains
20 Apr 2018 8:11 ashru2006 Open Access
1
 1 Protein Domains
20 Apr 2018 8:07 ashru2006 Open Access
1
 1 Protein Domains
20 Apr 2018 8:05 ashru2006 Open Access
1
 1 Protein Domains
20 Apr 2018 8:04 ashru2006 Open Access
1
 1 Protein Domains
20 Apr 2018 8:03 ashru2006 Open Access
1
 1 Protein Domains
25 Jun 2016 19:32 18575801_SY PSB2016
1
 6 Conserved domains
25 Jun 2016 10:54 YAPws PSB2016
1
 4 Summary of TO78M_5925010.1
15
 Conclusion
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Messages Lecteurs Sujet
21 Jul 2018 7:38 Janus PSB2018
1
 24 Contains putative protein
22 Jan 2018 4:32 nhminh0701 USTH2018
1
 19 Vai cut
25 Jun 2016 19:35 18575801_SY PSB2016
1
 5 conclusion
24 Jun 2016 17:34 xuejing PSB2016
1
 15 Annotathon report 18601881
24 Jun 2016 17:28 Verniselim PSB2016
1
 4 Conclusion
24 Jun 2016 16:50 18393000 PSB2016
1
 3 TO9D_5914020 Genomic DNA (: Algiers-Barcelona station 9 DCM)
24 Jun 2016 16:38 reggiepsb PSB2016
1
 4 Conclusion on Sequence TO9S_5805010.1
24 Jun 2016 16:25 SiowChen PSB2016
1
 4 >TO68D_5917010 Genomic DNA (: CapeTown-Ascencion station 68 DCM)
24 Jun 2016 16:14 SyawqinaAdlin PSB2016
1
 5 Possible Putative Protein of TO32S_5896010.1
24 Jun 2016 8:40 018548141 PSB2016
1
 11 Blastp findings of the -2, +1 and +3 reading frames of the genomic sequence
494
 Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs
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Messages Lecteurs Sujet
4 Apr 2018 10:08 GRP1_Jardin BISM2018
1
 6 Rendu de séquence
15 Mar 2018 17:27 sania Bioch2018
2
 20 joindre image, phylogeny, fonction moléculaire et processus biologique (menu déroulant)
16 Jan 2018 8:42 2017MeijeSolene AMIG2017
1
 8 Revenir en arrière quand on a cliqué par erreur sur évaluation
19 Jun 2017 13:18 Vincent-Marine Bioch2017
1
 4 Demande détail des notes de TP
25 Apr 2017 12:37 A_Quaiser_17 OBI_L2_2017
1
 12 soumission pour evaluation
3 Feb 2017 18:36 Vincent-Marine Bioch2017
2
 22 Problème avec TaxReport
5 Jan 2017 14:31 Laury BioCell2016
2
 29 Relance Oubli Soumission Correction 2
22 May 2016 21:02 FatouManon Clermont_2016
1
 46 Erreur Soumission de projet
5 Feb 2016 18:12 P_Hingamp_16 Bioch2016
16
 656 Questions (et réponses) sur les annotations
18 Dec 2015 13:19 P_Hingamp_15 BioCell2015
1
 25 Examen de bioinformatique
204
 Recherche d'ORF
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Messages Lecteurs Sujet
26 Apr 2018 12:52 Rosonp Bioch2018
3
 15 INTERPRO problème - sélection de séquences
20 Mar 2018 15:24 Rosonp Bioch2018
4
 20 Choix de l'ORF, codon d'initiation
14 Feb 2018 19:29 GRP1_HEURTEL BISM2018
4
 112 Quels ORFs à mettre dans le tableau d'illustration
6 Nov 2017 16:10 Anonymous01 BioCell2017
2
 90 Erreur de copier/coller
14 May 2017 19:19 ClaraSophie Bioch2017
2
 16 Cours Annotation Génome
28 Feb 2017 13:56 lasserve_aitou UCA_2016
1
 70 ORF FINDER
31 Jan 2017 16:19 ClaraSophie Bioch2017
3
 40 Search of ORF
3 Nov 2016 11:53 Bio3 BioCell2016
4
 72 2 OFR avec des homologues
18 Nov 2015 14:46 lun BioCell2015
2
 27 problème d'ORF
24 Oct 2015 14:53 JuSzLuCi BioCell2015
4
 69 ORF en sens indirecte prennant la totalité de la séquence.
461
 Recherche d'homologues: BLAST
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Messages Lecteurs Sujet
28 Apr 2018 12:58 MissDia95 Bioch2018
2
 4 TaxReports
28 Apr 2018 12:44 MissDia95 Bioch2018
2
 4 Rapport taxonomique du BLAST contre NR
25 Apr 2018 17:39 Rosonp Bioch2018
3
 8 choix du groupe d'étude
24 Apr 2018 18:43 Rosonp Bioch2018
2
 8 choix du groupe d'étude et du groupe extérieur
28 Feb 2018 11:01 GRP1_SMAINI BISM2018
4
 87 Taxonomy report et list report apres Blast
28 Feb 2018 10:57 GRP1_SMAINI BISM2018
1
 18 Blast NR et taxonomy
21 Apr 2017 11:31 Vincent-Marine Bioch2017
5
 50 Rapport taxonomique
10 Apr 2017 20:20 Alccio Bioch2017
8
 72 E-valeur seuil
2 Apr 2017 12:44 Yasmine_Alexey Bioch2017
3
 21 Comment c'est possible?
4 Jan 2017 9:30 WaitndSee BIOINFO@LYON_2017-2018
1
 17 Significant alignments
183
 Alignement multiple: CLUSTALW
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Messages Lecteurs Sujet
10 May 2018 21:56 sania Bioch2018
3
 11 Bug de Gblocks
28 Apr 2018 15:10 MissDia95 Bioch2018
2
 4 Protocole
14 May 2017 15:16 ClaraSophie Bioch2017
4
 36 Faute dans le cours matrice de programmation dynamique. Chapitre 2
30 Mar 2017 13:50 Vincent-Marine Bioch2017
2
 12 Problème de format
28 Oct 2016 15:07 estana BioCell2016
2
 38 groupe extérieur/ étude
9 Dec 2015 19:18 Pilgrim BioCell2015
2
 16 Erreur d'annotation pour la séquence avec le meilleur alignement
5 Dec 2015 11:49 JuSzLuCi BioCell2015
2
 29 Pertes de positions conservés
4 Dec 2014 8:40 ELPO BioCell2014
2
 25 Problème d'alignement avec les choix des groupes
4 Nov 2014 20:55 ioanaetlobna BioCell2014
2
 34 problème au niveau de l'alignement multiple
31 Oct 2014 15:28 SoulaNin BioCell2014
2
 47 Alignement multiple avec GBlocks
530
 Analyse phylogénétique
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Messages Lecteurs Sujet
11 May 2018 19:21 MissDia95 Bioch2018
1
 2 TaxReports/ Analyse des résutats/ table 5
9 May 2018 16:42 Rosonp Bioch2018
2
 5 Arbre phylogénétique
29 Apr 2018 14:18 Rosonp Bioch2018
2
 5 Taxreport
25 Apr 2018 16:48 LBMH Bioch2018
3
 12 Groupe extérieur
2 Apr 2018 16:25 GRP1_GESTIN BISM2018
3
 36 Taxons et groupes intérieurs/extérieurs
16 Apr 2017 18:39 ClaraSophie Bioch2017
2
 14 séquences eucaryotes
29 Mar 2017 9:23 Vincent-Marine Bioch2017
2
 12 Re enracinement de l'arbre (issus de la matrice de distance)
23 Feb 2017 10:56 Vincent-Marine Bioch2017
6
 48 Re enracinement de l'arbre (issus de la matrice de distance)
7 Nov 2016 15:26 SBDA BioCell2016
2
 38 AU SECOURS, URGENT!
31 Oct 2016 10:54 voyagel3 BioCell2016
2
 30 Hypothèse des événements évolutifs d'une espèce: DA ou HTG?
112
 Domaines conservés: INTERPRO
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Messages Lecteurs Sujet
4 May 2018 20:59 MissDia95 Bioch2018
2
 5 Les numéros d'IPR à mettre dans la table 2
3 May 2018 20:00 MissDia95 Bioch2018
2
 4 Protocole
29 Apr 2018 18:42 Rosonp Bioch2018
3
 5 GO term
29 Apr 2018 13:41 Rosonp Bioch2018
2
 3 Toujours de GO-terms avec INTERPRO séquence 1
27 Apr 2018 16:50 Rosonp Bioch2018
2
 7 Pas de GO-terms
2 Apr 2017 16:47 ClaraSophie Bioch2017
1
 8 Fiche interpro supprimée
8 Nov 2016 14:57 estana BioCell2016
2
 18 dommaines protéiques
28 Oct 2016 11:25 Laury BioCell2016
2
 25 Pas de domaine conservés retrouvés sur INTERPRO
10 May 2015 13:37 IrigarayA Bioch2015
1
 9 Présentation tableau InterPro
5 May 2015 0:43 IrigarayA Bioch2015
2
 13 Regroupement de domaines
42
 Fonctions moléculaires & Processus biologiques
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Messages Lecteurs Sujet
12 May 2018 23:15 MissDia95 Bioch2018
1
 2 Classification de l'ORF
24 Feb 2017 16:24 ClaraSophie Bioch2017
2
 16 Domaine proteique
23 Feb 2017 14:22 Vincent-Marine Bioch2017
3
 30 Choix de la fonction/processus et gène
27 Apr 2015 22:41 FranckLea Bioch2015
7
 79 Détermination du gène
22 Mar 2014 14:04 Tythan AMIG2016
2
 46 Problème de choix de la fonction moléculaire
23 Apr 2012 17:24 quentlude Biochimie 2012
2
 36 Symbole de gène
17 Feb 2011 17:18 BrothTeam Biochimie 2011
3
 51 pas de domaines structuraux sur interpro
16 Feb 2011 20:00 L3CharlotteAure Biochimie 2011
4
 125 Fonctions moléculaires, processus biologiques et taxonomie
17 Dec 2010 18:04 MELO BioCell2010
2
 48 Processus Biologique
21 Apr 2010 10:12 oralblandine Biochimie 2010
2
 33 détermination de la fonction et du processus
33
 Conclusion
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Messages Lecteurs Sujet
9 May 2015 19:14 LaurieNoemie Bioch2015
1
 9 Nombre de caractère limites de la conclusion
8 May 2015 16:09 FranckLea Bioch2015
2
 20 Poids moléculaire
27 Nov 2012 16:37 matou BioCell2012
1
 48 Oubli du code [A CORRIGER]
19 Apr 2012 10:16 Stellathan Biochimie 2012
2
 29 Symbole de gènes
3 Sep 2009 15:39 Hingamp BioCell 2005
9
 50 test: ignorez SVP
26 Apr 2008 21:25 BNPA Biochimie 2008
1
 20 notation et remarque
21 Apr 2008 23:54 bloublou Biochimie 2008
2
 48 problème d'interprétation d'une correction
21 Apr 2008 21:16 noura Biochimie 2008
3
 167 correction
14 Apr 2008 12:02 BNPA Biochimie 2008
1
 26 correction conclusion
14 Apr 2008 10:07 BNPA Biochimie 2008
1
 18 correction conclusion