Anntathon
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Messages Thèmes
17
 General Annotathon issues, using the interface, bugs etc.
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Messages Lecteurs Sujet
20 Apr 2018 8:30 ashru2006 Open Access
1
 38 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:29 ashru2006 Open Access
1
 11 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:24 ashru2006 Open Access
1
 9 Genomic Sequence
22 Feb 2018 20:39 E_Meglecz18 USTH2018
1
 27 closing time: 23:59 28th of February
6 Feb 2017 11:12 trungbui USTH2017
1
 39 Questions about the evaluation 1
31 May 2016 10:53 CamaliaTan PSB2016
2
 74 This sequence TO36D_5877010.1
21 Oct 2012 22:51 staggerwin Open Access
2
 43 Neighboring fragments
14 Apr 2010 16:30 bigecske2 UNIDEB
1
 28 annotálás
9 Jan 2009 21:38 Supervisor Open Access
1
 61 The "Rule book" is updated
5 Jan 2009 20:49 chevalier Open Access
3
 230 Informations de classification taxonomique
83
 ORF finding
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Messages Lecteurs Sujet
27 Jul 2018 11:32 Ryann PSB2018
1
 43 ORF
27 Jul 2018 11:27 Ryann PSB2018
1
 12 ORF
27 Jul 2018 11:11 Ryann PSB2018
1
 10 ORF
27 Jul 2018 9:31 NICSXY PSB2018
1
 11 orf_1
27 Jul 2018 9:25 NICSXY PSB2018
1
 14 ORF finding ORF1
26 Jul 2018 21:35 Jeremylimsy1995 Open Access
1
 7 orf
26 Jul 2018 10:57 riceline PSB2018
1
 9 FASTA FORMAT
26 Jul 2018 10:42 riceline PSB2018
1
 2 FASTA
23 Jul 2018 13:36 shaz PSB2018
1
 20 NO ORF
23 Jul 2018 7:14 Thasheeni PSB2018
1
 25 ORF
27
 Homolog hunting: BLAST
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Messages Lecteurs Sujet
27 Jul 2018 11:36 Ryann PSB2018
1
 28 BLAST Analysis
23 Jul 2018 7:48 Thasheeni PSB2018
1
 23 BLASTp
21 Jul 2018 7:40 Janus PSB2018
1
 31 No significant homology
21 Jul 2018 7:32 Janus PSB2018
1
 19 Only one homologue
21 Jul 2018 7:29 Janus PSB2018
1
 14 No putative protein
21 Jul 2018 7:28 Janus PSB2018
1
 20 Insignificant E-value
21 Jul 2018 7:23 Janus PSB2018
2
 56 E-value too insignificant
19 Jul 2018 12:16 Tessaoh PSB2018
1
 18 No homology
3 Jul 2017 18:39 jiaxin PSB2017
1
 50 New species found
25 Jun 2016 19:28 18575801_SY PSB2016
1
 25 blast
8
 Multiple sequence alignements
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Messages Lecteurs Sujet
27 Jul 2018 11:41 Ryann PSB2018
1
 8 MSA of top 5 sequences
23 Jul 2018 7:08 Thasheeni PSB2018
1
 33 Multiple alignment
28 Apr 2011 8:40 SAS BSB6_spring2011
1
 22 MSA
28 Apr 2011 8:18 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 22 clustalw2
27 Apr 2011 9:52 B_hajra BSB6_spring2011
1
 48 multiple sequence allignment
27 Apr 2011 9:37 B_hajra BSB6_spring2011
1
 18 multiple sequence allignment
18 Apr 2011 9:36 sanafarheen BSB6_spring2011
1
 16 msa :D
18 Apr 2011 9:29 sid_afo BSB6_spring2011
1
 23 multiple sequnce alignmnt
17
 Phylogenetic analysis
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Messages Lecteurs Sujet
25 Jun 2016 19:30 18575801_SY PSB2016
1
 29 Phylogenetic tree
28 Apr 2011 8:21 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 27 tree
27 Apr 2011 10:00 B_hajra BSB6_spring2011
1
 30 tree analysis
18 Apr 2011 9:38 sanafarheen BSB6_spring2011
1
 28 phylogenetic analysis
18 Apr 2011 9:32 sid_afo BSB6_spring2011
1
 22 tree details
19 May 2009 11:17 Maleeha BSB06CIIT
1
 28 annotation
27 Nov 2008 20:14 drhoads Open Access
11
 899 How to get a textual phylogenetic tree?
1
 Ontologies (molecular function & biological process)
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Messages Lecteurs Sujet
25 Jun 2016 19:34 18575801_SY PSB2016
1
 8 ontologies
15
 Conserved domains
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Messages Lecteurs Sujet
24 Jul 2018 9:57 Grace PSB2018
1
 14 no conserved domain and function had been identified
20 Apr 2018 8:15 ashru2006 Open Access
1
 15 INTERPROscan analysis
20 Apr 2018 8:14 ashru2006 Open Access
1
 11 Protein Domains
20 Apr 2018 8:11 ashru2006 Open Access
1
 6 Protein Domains
20 Apr 2018 8:07 ashru2006 Open Access
1
 4 Protein Domains
20 Apr 2018 8:05 ashru2006 Open Access
1
 3 Protein Domains
20 Apr 2018 8:04 ashru2006 Open Access
1
 4 Protein Domains
20 Apr 2018 8:03 ashru2006 Open Access
1
 5 Protein Domains
25 Jun 2016 19:32 18575801_SY PSB2016
1
 13 Conserved domains
25 Jun 2016 10:54 YAPws PSB2016
1
 8 Summary of TO78M_5925010.1
15
 Conclusion
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Messages Lecteurs Sujet
21 Jul 2018 7:38 Janus PSB2018
1
 25 Contains putative protein
22 Jan 2018 4:32 nhminh0701 USTH2018
1
 20 Vai cut
25 Jun 2016 19:35 18575801_SY PSB2016
1
 16 conclusion
24 Jun 2016 17:34 xuejing PSB2016
1
 18 Annotathon report 18601881
24 Jun 2016 17:28 Verniselim PSB2016
1
 14 Conclusion
24 Jun 2016 16:50 18393000 PSB2016
1
 5 TO9D_5914020 Genomic DNA (: Algiers-Barcelona station 9 DCM)
24 Jun 2016 16:38 reggiepsb PSB2016
1
 12 Conclusion on Sequence TO9S_5805010.1
24 Jun 2016 16:25 SiowChen PSB2016
1
 4 >TO68D_5917010 Genomic DNA (: CapeTown-Ascencion station 68 DCM)
24 Jun 2016 16:14 SyawqinaAdlin PSB2016
1
 7 Possible Putative Protein of TO32S_5896010.1
24 Jun 2016 8:40 018548141 PSB2016
1
 13 Blastp findings of the -2, +1 and +3 reading frames of the genomic sequence
629
 Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs
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Messages Lecteurs Sujet
21 Feb 2023 21:37 marieb L3-PGF-CTES-2023
3
 33 ouvrir 2 pages d'annotation
9 Feb 2023 19:36 marieb L3-PGF-CTES-2023
2
 30 erreur
24 Nov 2022 10:51 AugustinF L3-PGF-2022
1
 10 Oral de Bioinformatique
23 Nov 2022 13:16 bouillard L3-PGF-2022
2
 24 pip
28 Sep 2022 18:52 bouillard L3-PGF-2022
3
 47 recherche sequence
21 Apr 2022 14:07 Ma93 L3-PGF-CTES-2021
4
 56 choix du groupe d'étude
14 Apr 2022 9:10 Laurence L3-PGF-CTES-2021
2
 33 soumission séquence - passage de Annotation I à Corrrection I
17 Mar 2022 12:29 test_2022 Bioch2022
1
 21 Test
17 Mar 2022 12:24 B_Wirth_22 Bioch2022
2
 19 Test
14 Mar 2022 17:09 MarinePapot L3-PGF-CTES-2021
7
 125 NCBI Blast : bouton Reformat, autre option?
428
 Recherche d'ORF
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Messages Lecteurs Sujet
12 Mar 2023 19:35 noapardo L3-PGF-CTES-2023
4
 20 Choix d'ORF
27 Feb 2023 18:33 noapardo L3-PGF-CTES-2023
2
 20 Determiner les ORF individuellement
21 Feb 2023 19:24 retenodus L3-PGF-CTES-2023
3
 34 ORF non complet / classification
30 Jan 2023 10:27 Veronica L3-PGF-CTES-2023
3
 39 ORFs sans homologue sur Swiss Prot
30 Jan 2023 10:18 Veronica L3-PGF-CTES-2023
3
 48 Choix ORFs
16 Oct 2022 19:47 Lesboss BioCell2022
1
 42 diagramme orf
5 Oct 2022 15:17 LILYROSEPGF L3-PGF-2022
2
 36 Gènes absents
15 Apr 2022 15:43 miyuka Bioch2022
4
 36 Choix de l'ORF KNOWN
14 Apr 2022 15:34 AshleyRusso L3-PGF-CTES-2021
2
 29 ORF codant ? Pertinent pour annotation ?
11 Apr 2022 15:32 Dvo26 L3-PGF-CTES-2021
3
 45 choix de l'ORF
725
 Recherche d'homologues: BLAST
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Messages Lecteurs Sujet
14 Mar 2023 11:02 Sundance L3-PGF-CTES-2023
2
 14 E-valeur=0
13 Mar 2023 22:06 noapardo L3-PGF-CTES-2023
11
 63 "Definition List"
2 Mar 2023 19:23 noapardo L3-PGF-CTES-2023
1
 8 Proteines hypothetiques
2 Mar 2023 19:21 noapardo L3-PGF-CTES-2023
6
 42 Proteines hypothetiques
2 Mar 2023 19:16 noapardo L3-PGF-CTES-2023
3
 21 Aucune similarites trouvees
2 Mar 2023 17:19 marieb L3-PGF-CTES-2023
2
 14 e value 0
22 Feb 2023 12:19 Eva_f L3-PGF-CTES-2023
2
 16 % identité différent sur un même ORF
20 Feb 2023 8:50 marieb L3-PGF-CTES-2023
4
 33 choix de la séquence
27 Oct 2022 9:08 masantiago UCA_22_23
1
 46 Bioinfo
24 Apr 2022 19:14 PLQE Bioch2022
2
 31 Comment connaitre la e-value seuil ?
329
 Alignement multiple: CLUSTALW
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Messages Lecteurs Sujet
17 Mar 2023 0:28 AMIRA L3-PGF-CTES-2023
4
 16 Choix des groupes extérieurs
3 Mar 2023 22:27 AMIRA L3-PGF-CTES-2023
2
 14 Choix de groupe d'étude
2 Mar 2023 9:39 ivan-fay L3-PGF-CTES-2023
4
 32 resultats alignements multiples
28 Feb 2023 10:46 LEVY L3-PGF-CTES-2023
6
 42 choisir des séquences
28 Apr 2022 11:41 B_Wirth_22 Bioch2022
1
 13 Nombre d'aa manquants aux extrémités : /Blast et /clustalW
21 Apr 2022 15:08 SofiaOuarriche L3-PGF-CTES-2021
2
 28 annalyse de l'orf
13 Apr 2022 11:32 soleneA L3-PGF-CTES-2021
2
 31 Nombre de gap internes
12 Apr 2022 18:34 Anna L3-PGF-CTES-2021
4
 55 Pourcentage identité faible dans l'alignement
5 Apr 2022 14:35 MaeBinaud L3-PGF-CTES-2021
4
 88 Choix du groupe d'étude et du groupe extérieur
1 Apr 2022 17:13 maellejarnoux L3-PGF-CTES-2021
5
 80 Choix du groupe d'étude
918
 Analyse phylogénétique
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Messages Lecteurs Sujet
16 Mar 2023 9:30 ivan-fay L3-PGF-CTES-2023
2
 10 choix du groupe
10 Mar 2023 0:35 LEVY L3-PGF-CTES-2023
3
 15 mélange de groupe dans l'arbre
9 Mar 2023 13:06 marieb L3-PGF-CTES-2023
2
 16 RACINE DE LARBRE
9 Mar 2023 10:08 LEVY L3-PGF-CTES-2023
4
 22 construction de l'arbre
9 Mar 2023 6:58 retenodus L3-PGF-CTES-2023
6
 39 Alphaproteobacteria sous classes
2 Mar 2023 18:53 ivan-fay L3-PGF-CTES-2023
5
 50 enracinement d'arbre par taxa du groupe ext
2 Mar 2023 15:16 ivan-fay L3-PGF-CTES-2023
2
 22 melanges des groupes
11 Feb 2023 20:42 Philippe L3-PGF-CTES-2023
2
 26 Mélange de groupes lors de l'arbre phylogénétique
28 May 2022 19:08 Anissa L3-PGF-CTES-2021
2
 11 modification arbre et analyse
24 Apr 2022 20:57 SofiaOuarriche L3-PGF-CTES-2021
2
 24 enracinement de l'arbre
152
 Domaines conservés: INTERPRO
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Messages Lecteurs Sujet
24 Nov 2022 15:00 LesPerdus BioCell2022
1
 27 Petit problème sur la recherche de domaines protéiques INTERPRO
1 May 2022 17:41 SRSM Bioch2022
2
 9 Choix du domaine
11 Apr 2022 23:00 Sylia Bioch2022
3
 36 Domaine protéique non conservé dans la famille
26 Mar 2022 12:10 mongeoussada Bioch2022
2
 30 Choix du domaine retenu
13 Oct 2021 20:01 ilonaMi Master-Mer-2021
3
 32 Choix du profil Interpro pour table 2
13 Oct 2021 19:57 ilonaMi Master-Mer-2021
1
 7 Choix du profil Interpro pour table 2
13 Oct 2021 19:56 ilonaMi Master-Mer-2021
1
 8 Choix du profil Interpro pour table 2
4 Oct 2021 18:16 emmaRO Master-Mer-2021
2
 29 Domaines protéiques à annoter
27 Sep 2021 17:42 Thibault_A Master-Mer-2021
2
 32 Domaines protéiques INTERPRO
20 Sep 2021 11:15 ilonaMi Master-Mer-2021
2
 30 Base de données
50
 Fonctions moléculaires & Processus biologiques
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Messages Lecteurs Sujet
29 Apr 2022 11:21 Faiznaleann Bioch2022
4
 31 Contradiction
28 Apr 2022 10:37 B_Wirth_22 Bioch2022
1
 11 Choix du Processus biologique
21 May 2019 18:52 DebB L3-PGF-CTES-2018
3
 50 Doute sur le groupe d'étude et la séquence analysée
12 May 2018 23:15 MissDia95 Bioch2018
1
 13 Classification de l'ORF
24 Feb 2017 16:24 ClaraSophie Bioch2017
2
 46 Domaine proteique
23 Feb 2017 14:22 Vincent-Marine Bioch2017
3
 64 Choix de la fonction/processus et gène
27 Apr 2015 22:41 FranckLea Bioch2015
7
 136 Détermination du gène
22 Mar 2014 14:04 Tythan AMIG2016
2
 54 Problème de choix de la fonction moléculaire
23 Apr 2012 17:24 quentlude Biochimie 2012
2
 65 Symbole de gène
17 Feb 2011 17:18 BrothTeam Biochimie 2011
3
 66 pas de domaines structuraux sur interpro
121
 Conclusion
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Messages Lecteurs Sujet
12 Oct 2022 12:16 IMalki L3-PGF-2022
1
 17 Pour sars Cov 1
28 Sep 2022 14:18 LILYROSEPGF L3-PGF-2022
1
 18 J'ai trouvé des nouveaux génomes + génome privé
27 Sep 2022 17:48 P_Hingamp_PGF22 L3-PGF-2022
1
 12 Paru hier : article "Origine du SARS-CoV-2 et du Covid-19 : le point sur l’enquête en cours et les dernières hypothèses"
26 Sep 2022 18:51 P_Hingamp_PGF22 L3-PGF-2022
1
 11 Le virus qui venait du froid...
23 Sep 2022 10:38 hoda1 L3-PGF-2022
1
 21 J'ai trouvé le génome complet de la souche BANAL-20-52/Laos/2020 identifiée par l'Institut Pasteur
22 Sep 2022 20:27 LILYROSEPGF L3-PGF-2022
1
 20 J'ai trouvé le génome complet de SARS-Cov1 (Souche Tor2)
22 Sep 2022 20:18 LILYROSEPGF L3-PGF-2022
1
 18 J'ai trouvé le génome complet de SARS-Cov2 - Wuhan-Hu-1
22 Sep 2022 17:41 P_Hingamp_PGF22 L3-PGF-2022
2
 20 Max une séquence de référence par étudiant :) Et d'autres séquences de références sont les bienvenues
22 Sep 2022 17:38 chamcham L3-PGF-2022
1
 20 J'ai trouvé le génome du MERS
22 Sep 2022 17:35 IMalki L3-PGF-2022
1
 19 j'ai trouvé le genome du Sars-CoV 2