Messages Thèmes
17
General Annotathon issues, using the interface, bugs etc.
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Messages Lecteurs Sujet
20 Apr 2018 8:30 ashru2006 Open Access
1
27 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:29 ashru2006 Open Access
1
7 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:24 ashru2006 Open Access
1
7 Genomic Sequence
22 Feb 2018 20:39 E_Meglecz18 USTH2018
1
23 closing time: 23:59 28th of February
6 Feb 2017 11:12 trungbui USTH2017
1
35 Questions about the evaluation 1
31 May 2016 10:53 CamaliaTan PSB2016
2
65 This sequence TO36D_5877010.1
21 Oct 2012 22:51 staggerwin Open Access
2
43 Neighboring fragments
14 Apr 2010 16:30 bigecske2 UNIDEB
1
27 annotálás
9 Jan 2009 21:38 Supervisor Open Access
1
59 The "Rule book" is updated
5 Jan 2009 20:49 chevalier Open Access
3
206 Informations de classification taxonomique
83
ORF finding
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Messages Lecteurs Sujet
27 Jul 2018 11:32 Ryann PSB2018
1
31 ORF
27 Jul 2018 11:27 Ryann PSB2018
1
9 ORF
27 Jul 2018 11:11 Ryann PSB2018
1
6 ORF
27 Jul 2018 9:31 NICSXY PSB2018
1
8 orf_1
27 Jul 2018 9:25 NICSXY PSB2018
1
8 ORF finding ORF1
26 Jul 2018 21:35 Jeremylimsy1995 Open Access
1
6 orf
26 Jul 2018 10:57 riceline PSB2018
1
7 FASTA FORMAT
26 Jul 2018 10:42 riceline PSB2018
1
2 FASTA
23 Jul 2018 13:36 shaz PSB2018
1
17 NO ORF
23 Jul 2018 7:14 Thasheeni PSB2018
1
23 ORF
27
Homolog hunting: BLAST
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Messages Lecteurs Sujet
27 Jul 2018 11:36 Ryann PSB2018
1
15 BLAST Analysis
23 Jul 2018 7:48 Thasheeni PSB2018
1
18 BLASTp
21 Jul 2018 7:40 Janus PSB2018
1
26 No significant homology
21 Jul 2018 7:32 Janus PSB2018
1
17 Only one homologue
21 Jul 2018 7:29 Janus PSB2018
1
10 No putative protein
21 Jul 2018 7:28 Janus PSB2018
1
16 Insignificant E-value
21 Jul 2018 7:23 Janus PSB2018
2
50 E-value too insignificant
19 Jul 2018 12:16 Tessaoh PSB2018
1
14 No homology
3 Jul 2017 18:39 jiaxin PSB2017
1
48 New species found
25 Jun 2016 19:28 18575801_SY PSB2016
1
19 blast
8
Multiple sequence alignements
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Messages Lecteurs Sujet
27 Jul 2018 11:41 Ryann PSB2018
1
5 MSA of top 5 sequences
23 Jul 2018 7:08 Thasheeni PSB2018
1
26 Multiple alignment
28 Apr 2011 8:40 SAS BSB6_spring2011
1
22 MSA
28 Apr 2011 8:18 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
21 clustalw2
27 Apr 2011 9:52 B_hajra BSB6_spring2011
1
38 multiple sequence allignment
27 Apr 2011 9:37 B_hajra BSB6_spring2011
1
16 multiple sequence allignment
18 Apr 2011 9:36 sanafarheen BSB6_spring2011
1
15 msa :D
18 Apr 2011 9:29 sid_afo BSB6_spring2011
1
18 multiple sequnce alignmnt
17
Phylogenetic analysis
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Messages Lecteurs Sujet
25 Jun 2016 19:30 18575801_SY PSB2016
1
18 Phylogenetic tree
28 Apr 2011 8:21 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
23 tree
27 Apr 2011 10:00 B_hajra BSB6_spring2011
1
27 tree analysis
18 Apr 2011 9:38 sanafarheen BSB6_spring2011
1
23 phylogenetic analysis
18 Apr 2011 9:32 sid_afo BSB6_spring2011
1
19 tree details
19 May 2009 11:17 Maleeha BSB06CIIT
1
27 annotation
27 Nov 2008 20:14 drhoads Open Access
11
821 How to get a textual phylogenetic tree?
1
Ontologies (molecular function & biological process)
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Messages Lecteurs Sujet
25 Jun 2016 19:34 18575801_SY PSB2016
1
5 ontologies
15
Conserved domains
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Messages Lecteurs Sujet
24 Jul 2018 9:57 Grace PSB2018
1
12 no conserved domain and function had been identified
20 Apr 2018 8:15 ashru2006 Open Access
1
8 INTERPROscan analysis
20 Apr 2018 8:14 ashru2006 Open Access
1
5 Protein Domains
20 Apr 2018 8:11 ashru2006 Open Access
1
3 Protein Domains
20 Apr 2018 8:07 ashru2006 Open Access
1
2 Protein Domains
20 Apr 2018 8:05 ashru2006 Open Access
1
2 Protein Domains
20 Apr 2018 8:04 ashru2006 Open Access
1
1 Protein Domains
20 Apr 2018 8:03 ashru2006 Open Access
1
4 Protein Domains
25 Jun 2016 19:32 18575801_SY PSB2016
1
6 Conserved domains
25 Jun 2016 10:54 YAPws PSB2016
1
6 Summary of TO78M_5925010.1
15
Conclusion
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Messages Lecteurs Sujet
21 Jul 2018 7:38 Janus PSB2018
1
24 Contains putative protein
22 Jan 2018 4:32 nhminh0701 USTH2018
1
19 Vai cut
25 Jun 2016 19:35 18575801_SY PSB2016
1
11 conclusion
24 Jun 2016 17:34 xuejing PSB2016
1
18 Annotathon report 18601881
24 Jun 2016 17:28 Verniselim PSB2016
1
10 Conclusion
24 Jun 2016 16:50 18393000 PSB2016
1
4 TO9D_5914020 Genomic DNA (: Algiers-Barcelona station 9 DCM)
24 Jun 2016 16:38 reggiepsb PSB2016
1
8 Conclusion on Sequence TO9S_5805010.1
24 Jun 2016 16:25 SiowChen PSB2016
1
4 >TO68D_5917010 Genomic DNA (: CapeTown-Ascencion station 68 DCM)
24 Jun 2016 16:14 SyawqinaAdlin PSB2016
1
6 Possible Putative Protein of TO32S_5896010.1
24 Jun 2016 8:40 018548141 PSB2016
1
12 Blastp findings of the -2, +1 and +3 reading frames of the genomic sequence
597
Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs
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Messages Lecteurs Sujet
8 Apr 2021 16:03 CHI L3-PGF-CTES-2020
3
36 diagramme des ORFs détecters
31 Mar 2021 10:43 Meglecz20CTES L3-PGF-CTES-2020
3
60 Grille d’évaluation, rédaction de rapport
30 Mar 2021 9:48 B_Wirth_etu Bioch2021
2
40 Test
29 Mar 2021 17:00 A_Quaiser_21 OBI_2021
1
33 pas de OBI/BIM cette semaine
29 Mar 2021 10:15 S_TEMPEL_WUT_21 WutAMU2021
2
53 Email de Sebastien Tempel
22 Mar 2021 8:20 Meglecz20CTES L3-PGF-CTES-2020
2
23 Important! BDD refseq_protein vs. NR
22 Dec 2020 0:08 isnaem BioCell2020
1
17 Fragmant à évaluer
2 Dec 2020 11:37 TheoRayane M1_Orsay_2020
1
7 BLAST taxonomic report
20 Nov 2020 14:01 A_Quaiser_20M2 M2_Rennes
1
28 Bonjour sur le forum
15 Nov 2020 16:30 ChaDev Master-Mer-2020
7
55 Email
370
Recherche d'ORF
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Messages Lecteurs Sujet
13 Apr 2021 14:33 Ampen-sarah L3-PGF-CTES-2020
4
30 Codon stop
11 Apr 2021 16:43 esther L3-PGF-CTES-2020
4
21 POYPEPTIDE SIZE
1 Apr 2021 15:09 Ampen-sarah L3-PGF-CTES-2020
4
44 Homologues
23 Mar 2021 21:31 Hope L3-PGF-CTES-2020
2
33 Choix de l'orf
22 Mar 2021 12:05 AlexTom L3-PGF-CTES-2020
5
43 Problème de résultat comparatif sur ORF SMS et NCBI
21 Mar 2021 17:05 lea19 L3-PGF-CTES-2020
2
20 compréhension des pourcentages d'identités
21 Mar 2021 15:27 AlexTom L3-PGF-CTES-2020
3
34 NCBI utilisation
21 Mar 2021 14:49 Julien051 L3-PGF-CTES-2020
4
56 <50% d'identité et hypothetic protein
21 Mar 2021 10:58 Julien051 L3-PGF-CTES-2020
4
45 Codon STOP dans la séquence.
20 Mar 2021 16:14 Ampen-sarah L3-PGF-CTES-2020
5
55 Fonction
623
Recherche d'homologues: BLAST
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Messages Lecteurs Sujet
16 Apr 2021 13:38 rachel L3-PGF-CTES-2020
2
6 e value et identité
16 Apr 2021 13:22 rachel L3-PGF-CTES-2020
3
5 pourcentage d'identité
13 Apr 2021 10:41 mrgRV L3-PGF-CTES-2020
3
22 différences entre résultats NR/SwissProt et GO
11 Apr 2021 17:27 esther L3-PGF-CTES-2020
2
11 swissprott
10 Apr 2021 14:30 Hope L3-PGF-CTES-2020
2
10 swissprot
8 Apr 2021 12:41 Hope L3-PGF-CTES-2020
4
18 identité 100% et moins
7 Apr 2021 15:03 LCAEL L3-PGF-CTES-2020
2
18 QuickGO
6 Apr 2021 22:38 sterna L3-PGF-CTES-2020
2
19 e- value seul
2 Apr 2021 16:23 aminaza L3-PGF-CTES-2020
2
16 quickgo
2 Apr 2021 12:46 lea19 L3-PGF-CTES-2020
2
21 quick go
259
Alignement multiple: CLUSTALW
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Messages Lecteurs Sujet
16 Apr 2021 10:01 ElisaM L3-PGF-CTES-2020
1
4 Pause D'AA
16 Apr 2021 10:01 ElisaM L3-PGF-CTES-2020
1
4 Pause D'AA
14 Apr 2021 22:56 lea19 L3-PGF-CTES-2020
3
12 alignement
11 Apr 2021 19:27 sterna L3-PGF-CTES-2020
8
37 positions conservées inf 100
11 Apr 2021 17:15 NAOMIE L3-PGF-CTES-2020
4
24 Alignement multiple erreur
11 Apr 2021 1:12 Hope L3-PGF-CTES-2020
2
13 a.multiple
10 Apr 2021 23:29 Hope L3-PGF-CTES-2020
2
15 nombre de position
7 Apr 2021 17:38 aminaza L3-PGF-CTES-2020
2
18 alignement
23 Mar 2021 10:15 Benjii936 L3-PGF-CTES-2020
8
127 homologie plutot faible
7 Nov 2020 20:15 Fanny_Smahan PGF-2020
2
18 alignement
764
Analyse phylogénétique
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Messages Lecteurs Sujet
16 Apr 2021 18:54 Ampen-sarah L3-PGF-CTES-2020
2
3 Arbre
16 Apr 2021 13:51 ThomasW L3-PGF-CTES-2020
2
4 e-value Groupe d'étude
15 Apr 2021 21:47 lea19 L3-PGF-CTES-2020
1
5 Arbre
13 Apr 2021 15:07 LCAEL L3-PGF-CTES-2020
7
88 Groupe d'étude et groupe extérieur
13 Apr 2021 13:31 Ampen-sarah L3-PGF-CTES-2020
3
15 Taxonomie
11 Apr 2021 16:10 ThomasW L3-PGF-CTES-2020
2
15 Test duplication
11 Apr 2021 16:08 Hope L3-PGF-CTES-2020
3
33 arbre groupe ext toujours en plein milieu
11 Apr 2021 15:59 ThomasW L3-PGF-CTES-2020
2
12 tblastn : très nombreuses séquences homologues pour un même génome ?
11 Apr 2021 14:00 Hope L3-PGF-CTES-2020
4
35 enraciner l'arbre
7 Apr 2021 15:32 Ampen-sarah L3-PGF-CTES-2020
14
154 Groupe extérieur
133
Domaines conservés: INTERPRO
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Messages Lecteurs Sujet
26 Nov 2020 15:11 c18015311 Master-Mer-2020
5
25 Choix des domaines retenus
18 Oct 2020 14:58 ChaDev Master-Mer-2020
2
16 Fonction biologique
8 Sep 2020 11:57 eugtest BioCell2020
1
54 pred cdsearch
20 Mar 2020 15:05 bylka Bioch2020
5
93 analyse de l'arbre et de l'alignement multiple
13 Nov 2019 0:08 RLPGF PGF-2019
2
41 Domaine protéique étrange
9 Feb 2019 21:11 GRA1_Antoine BISM2019
6
192 Infos à mettre dans le Tableau
4 May 2018 20:59 MissDia95 Bioch2018
2
21 Les numéros d'IPR à mettre dans la table 2
3 May 2018 20:00 MissDia95 Bioch2018
2
22 Protocole
29 Apr 2018 18:42 Rosonp Bioch2018
3
26 GO term
29 Apr 2018 13:41 Rosonp Bioch2018
2
11 Toujours de GO-terms avec INTERPRO séquence 1
45
Fonctions moléculaires & Processus biologiques
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Messages Lecteurs Sujet
21 May 2019 18:52 DebB L3-PGF-CTES-2018
3
31 Doute sur le groupe d'étude et la séquence analysée
12 May 2018 23:15 MissDia95 Bioch2018
1
9 Classification de l'ORF
24 Feb 2017 16:24 ClaraSophie Bioch2017
2
36 Domaine proteique
23 Feb 2017 14:22 Vincent-Marine Bioch2017
3
49 Choix de la fonction/processus et gène
27 Apr 2015 22:41 FranckLea Bioch2015
7
100 Détermination du gène
22 Mar 2014 14:04 Tythan AMIG2016
2
50 Problème de choix de la fonction moléculaire
23 Apr 2012 17:24 quentlude Biochimie 2012
2
50 Symbole de gène
17 Feb 2011 17:18 BrothTeam Biochimie 2011
3
60 pas de domaines structuraux sur interpro
16 Feb 2011 20:00 L3CharlotteAure Biochimie 2011
4
149 Fonctions moléculaires, processus biologiques et taxonomie
17 Dec 2010 18:04 MELO BioCell2010
2
56 Processus Biologique
85
Conclusion
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Messages Lecteurs Sujet
30 Mar 2021 14:51 Benjii936 L3-PGF-CTES-2020
2
38 aide
19 Nov 2020 11:32 ChaDev Master-Mer-2020
4
36 Correction
18 Nov 2020 16:43 ChaDev Master-Mer-2020
2
11 OGA
18 Nov 2020 16:37 ChaDev Master-Mer-2020
3
21 OGA
4 Nov 2020 18:50 AnouarBillal PGF-2020
2
18 Trop de caractère dans notre conclusion
17 Sep 2020 16:44 mrsingh L3-PGF-CTES-2019
1
2 remise de l'Annotathon et attente de confirmation de l'heure et du lieu de l'examen
10 Sep 2020 14:10 mrsingh L3-PGF-CTES-2019
7
27 Terminé à l'instant
24 Apr 2020 14:30 eleonore L3-PGF-CTES-2019
5
47 conclusion
17 Apr 2020 10:54 eleonore L3-PGF-CTES-2019
8
40 Arbre
7 Apr 2020 21:26 eleonore L3-PGF-CTES-2019
5
47 arbre