Anntathon
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Messages Thèmes
20
 General Annotathon issues, using the interface, bugs etc.
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Messages Lecteurs Sujet
25 Feb 2024 3:49 T_TRAN_USTH24 USTH2024
1
 45 Lecture material
5 Sep 2023 5:09 zxjin426 KU-ILAS-23
2
 40 Errors
20 Apr 2018 8:30 ashru2006 Open Access
1
 51 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:29 ashru2006 Open Access
1
 14 Genomic Sequence
20 Apr 2018 8:24 ashru2006 Open Access
1
 11 Genomic Sequence
22 Feb 2018 20:39 E_Meglecz18 USTH2018
1
 31 closing time: 23:59 28th of February
6 Feb 2017 11:12 trungbui USTH2017
1
 43 Questions about the evaluation 1
31 May 2016 10:53 CamaliaTan PSB2016
2
 81 This sequence TO36D_5877010.1
21 Oct 2012 22:51 staggerwin Open Access
2
 47 Neighboring fragments
14 Apr 2010 16:30 bigecske2 UNIDEB
1
 30 annotálás
83
 ORF finding
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Messages Lecteurs Sujet
27 Jul 2018 11:32 Ryann PSB2018
1
 55 ORF
27 Jul 2018 11:27 Ryann PSB2018
1
 12 ORF
27 Jul 2018 11:11 Ryann PSB2018
1
 11 ORF
27 Jul 2018 9:31 NICSXY PSB2018
1
 14 orf_1
27 Jul 2018 9:25 NICSXY PSB2018
1
 22 ORF finding ORF1
26 Jul 2018 21:35 Jeremylimsy1995 Open Access
1
 12 orf
26 Jul 2018 10:57 riceline PSB2018
1
 11 FASTA FORMAT
26 Jul 2018 10:42 riceline PSB2018
1
 4 FASTA
23 Jul 2018 13:36 shaz PSB2018
1
 25 NO ORF
23 Jul 2018 7:14 Thasheeni PSB2018
1
 30 ORF
32
 Homolog hunting: BLAST
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Messages Lecteurs Sujet
7 Sep 2023 8:44 P_Hingamp_KU KU-ILAS-23
1
 14 For detailed book chapter on BLAST scoring and E-values
6 Sep 2023 8:29 P_Hingamp_KU KU-ILAS-23
4
 63 Concerning Sora's mysterious truncated BLAST lists of hits
27 Jul 2018 11:36 Ryann PSB2018
1
 35 BLAST Analysis
23 Jul 2018 7:48 Thasheeni PSB2018
1
 29 BLASTp
21 Jul 2018 7:40 Janus PSB2018
1
 32 No significant homology
21 Jul 2018 7:32 Janus PSB2018
1
 21 Only one homologue
21 Jul 2018 7:29 Janus PSB2018
1
 15 No putative protein
21 Jul 2018 7:28 Janus PSB2018
1
 21 Insignificant E-value
21 Jul 2018 7:23 Janus PSB2018
2
 66 E-value too insignificant
19 Jul 2018 12:16 Tessaoh PSB2018
1
 18 No homology
8
 Multiple sequence alignements
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Messages Lecteurs Sujet
27 Jul 2018 11:41 Ryann PSB2018
1
 12 MSA of top 5 sequences
23 Jul 2018 7:08 Thasheeni PSB2018
1
 37 Multiple alignment
28 Apr 2011 8:40 SAS BSB6_spring2011
1
 24 MSA
28 Apr 2011 8:18 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 25 clustalw2
27 Apr 2011 9:52 B_hajra BSB6_spring2011
1
 51 multiple sequence allignment
27 Apr 2011 9:37 B_hajra BSB6_spring2011
1
 20 multiple sequence allignment
18 Apr 2011 9:36 sanafarheen BSB6_spring2011
1
 17 msa :D
18 Apr 2011 9:29 sid_afo BSB6_spring2011
1
 25 multiple sequnce alignmnt
17
 Phylogenetic analysis
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Messages Lecteurs Sujet
25 Jun 2016 19:30 18575801_SY PSB2016
1
 37 Phylogenetic tree
28 Apr 2011 8:21 HiraEjaz BSB6_spring2011
1
 30 tree
27 Apr 2011 10:00 B_hajra BSB6_spring2011
1
 34 tree analysis
18 Apr 2011 9:38 sanafarheen BSB6_spring2011
1
 32 phylogenetic analysis
18 Apr 2011 9:32 sid_afo BSB6_spring2011
1
 24 tree details
19 May 2009 11:17 Maleeha BSB06CIIT
1
 31 annotation
27 Nov 2008 20:14 drhoads Open Access
11
 933 How to get a textual phylogenetic tree?
1
 Ontologies (molecular function & biological process)
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Messages Lecteurs Sujet
25 Jun 2016 19:34 18575801_SY PSB2016
1
 9 ontologies
15
 Conserved domains
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Messages Lecteurs Sujet
24 Jul 2018 9:57 Grace PSB2018
1
 18 no conserved domain and function had been identified
20 Apr 2018 8:15 ashru2006 Open Access
1
 22 INTERPROscan analysis
20 Apr 2018 8:14 ashru2006 Open Access
1
 14 Protein Domains
20 Apr 2018 8:11 ashru2006 Open Access
1
 7 Protein Domains
20 Apr 2018 8:07 ashru2006 Open Access
1
 6 Protein Domains
20 Apr 2018 8:05 ashru2006 Open Access
1
 3 Protein Domains
20 Apr 2018 8:04 ashru2006 Open Access
1
 6 Protein Domains
20 Apr 2018 8:03 ashru2006 Open Access
1
 7 Protein Domains
25 Jun 2016 19:32 18575801_SY PSB2016
1
 15 Conserved domains
25 Jun 2016 10:54 YAPws PSB2016
1
 10 Summary of TO78M_5925010.1
15
 Conclusion
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Messages Lecteurs Sujet
21 Jul 2018 7:38 Janus PSB2018
1
 29 Contains putative protein
22 Jan 2018 4:32 nhminh0701 USTH2018
1
 21 Vai cut
25 Jun 2016 19:35 18575801_SY PSB2016
1
 20 conclusion
24 Jun 2016 17:34 xuejing PSB2016
1
 19 Annotathon report 18601881
24 Jun 2016 17:28 Verniselim PSB2016
1
 15 Conclusion
24 Jun 2016 16:50 18393000 PSB2016
1
 7 TO9D_5914020 Genomic DNA (: Algiers-Barcelona station 9 DCM)
24 Jun 2016 16:38 reggiepsb PSB2016
1
 13 Conclusion on Sequence TO9S_5805010.1
24 Jun 2016 16:25 SiowChen PSB2016
1
 4 >TO68D_5917010 Genomic DNA (: CapeTown-Ascencion station 68 DCM)
24 Jun 2016 16:14 SyawqinaAdlin PSB2016
1
 7 Possible Putative Protein of TO32S_5896010.1
24 Jun 2016 8:40 018548141 PSB2016
1
 14 Blastp findings of the -2, +1 and +3 reading frames of the genomic sequence
646
 Annotathon: généralités, fonctionnement & bugs
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Messages Lecteurs Sujet
3 Jun 2025 13:59 Kaixuan WUTAMU2025
1
 5 Annotations de HMP2_12489010.112
18 Dec 2024 13:55 NurayLea2024 Bioch2024bis
2
 20 Annotation séquence 2 date limite
28 Nov 2024 14:43 test_2024 Bioch2024bis
1
 16 Test
28 Nov 2024 14:41 B_Wirth_24bis Bioch2024bis
3
 31 Questions concernant votre 2ème Annotation
28 Nov 2024 14:28 PH_test25 JustTesting
1
 1 t1
5 Nov 2023 22:19 levana L3-PGF-CTES-2023-24
2
 38 doute annotation séquence
2 Nov 2023 16:34 Spoon L3-PGF-CTES-2023-24
2
 28 Choix de sequence
1 Jul 2023 7:10 Mounire L3-PGF-CTES-2023
1
 5 Fragment de séquence provenant de la mer Baltique. Annotathon
21 Feb 2023 21:37 marieb L3-PGF-CTES-2023
3
 54 ouvrir 2 pages d'annotation
9 Feb 2023 19:36 marieb L3-PGF-CTES-2023
2
 42 erreur
467
 Recherche d'ORF
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Messages Lecteurs Sujet
1 Jun 2025 5:31 YangWang WUTAMU2025
1
 3 une erreur de Figure 1
26 Apr 2024 14:27 B_WIRTH_WUT_24 WutAMU2024
3
 21 Message de 发送自
26 Apr 2024 11:45 B_WIRTH_WUT_24 WutAMU2024
2
 10 Message de HU Lingao (seq HMP2_11729010.77)
15 Apr 2024 9:01 chengbams WutAMU2024
2
 46 ORF complet en 5' ou no?
14 Feb 2024 18:41 Rapha L3_BBMCG_Limoges2024
1
 18 Recherche d'ORF
12 Feb 2024 16:57 merlishhh L3_BBMCG_Limoges2024
2
 37 ORF finding
27 Nov 2023 15:00 R_Delage Rennes_M2_2023
1
 10 ORF Finder for reverse sequence (with SMS)
27 Nov 2023 15:00 D_Roy Rennes_M2_2023
1
 9 SMS ORfinder for reverse sequence
27 Nov 2023 14:53 AntoineMD Rennes_M2_2023
1
 10 1 ORF found frame 3 direct
27 Nov 2023 14:50 AntoineMD Rennes_M2_2023
1
 6 No ORFs were found
789
 Recherche d'homologues: BLAST
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Messages Lecteurs Sujet
14 Apr 2025 10:11 BWIRTH_WUT25 WUTAMU2025
1
 28 Outil Function_TaxReport
15 Apr 2024 9:42 chengbams WutAMU2024
2
 30 e-value seuil par SP
15 Apr 2024 9:30 chengbams WutAMU2024
2
 16 differences between activity enzymatique and process biologique
15 Apr 2024 9:18 chengbams WutAMU2024
2
 28 list de Domaines Protéiques, le façon de rejeter certaine domaine
28 Nov 2023 16:44 Spoon L3-PGF-CTES-2023-24
2
 30 e-valeur seuil
26 Nov 2023 16:08 Spoon L3-PGF-CTES-2023-24
2
 16 Fonctions des sequences
25 Nov 2023 19:19 levana L3-PGF-CTES-2023-24
2
 19 plus d'alignement homologue groupe externe que groupe d'etude
25 Nov 2023 1:49 odessaH L3-PGF-CTES-2023-24
2
 23 Tableau de fonctions
24 Nov 2023 9:02 FlorentinS L3-PGF-CTES-2023-24
4
 48 Choix du niveau de classification taxonomique et du groupe d'étude
23 Nov 2023 20:00 levana L3-PGF-CTES-2023-24
2
 16 groupe externe
362
 Alignement multiple: CLUSTALW
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Messages Lecteurs Sujet
23 Nov 2023 20:33 Cate L3-PGF-CTES-2023-24
3
 18 Arbre
23 Nov 2023 17:09 avigail L3-PGF-CTES-2023-24
7
 70 phylogénie
9 Nov 2023 21:31 Yael L3-PGF-CTES-2023-24
7
 79 séquences qui commencent en amont de mon ORF
29 May 2023 10:14 wuhan_killers WutAMU2023
2
 28 Changer le nombre d'INDELS.
12 May 2023 0:28 Varly L3-PGF-CTES-2023
2
 14 Nombres de séquences
28 Apr 2023 17:11 B_Wirth_23 Bioch2023
1
 9 Trouver les résidus importants pour la fonction/activité de notre famille de protéines
14 Apr 2023 16:14 Printemps2023 L3-PGF-CTES-2023
1
 11 ORF beaucoup plus court que les homologues
14 Apr 2023 13:57 Quentacio Bioch2023
2
 27 Construction de l'arbre
31 Mar 2023 13:21 noapardo L3-PGF-CTES-2023
6
 68 Choix de groupe d'étude
17 Mar 2023 0:28 AMIRA L3-PGF-CTES-2023
4
 36 Choix des groupes extérieurs
1034
 Analyse phylogénétique
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Messages Lecteurs Sujet
23 May 2025 14:25 guaguaw WUTAMU2025
1
 6 Concernant l’origine de l’évolution horizontale de Gext
9 May 2025 9:12 BWIRTH_WUT25 WUTAMU2025
1
 10 Phylogénie de référence - Arbre des espèces
28 Apr 2024 19:13 julien12138 WutAMU2024
1
 7 La version correcte n'est pas sauvegardée
26 Apr 2024 14:09 B_WIRTH_WUT_24 WutAMU2024
2
 16 Message de 逯泽晖
25 Apr 2024 12:03 B_WIRTH_WUT_24 WutAMU2024
2
 18 Message de FAN Chenyue (séquence HMP2_11689030.117)
25 Apr 2024 12:02 B_WIRTH_WUT_24 WutAMU2024
1
 3 Message de FAN Chenyue (séquence HMP2_11689030.117)
22 Apr 2024 13:11 chengbams WutAMU2024
2
 14 Arbre
18 Apr 2024 10:06 B_WIRTH_WUT_24 WutAMU2024
1
 12 Message de Weizhe LU (séquence HMP2_11678060.146)
7 Jan 2024 17:50 TEHI L3-PGF-CTES-2023-24
6
 72 Réenraciner l'arbre
26 Nov 2023 14:36 levana L3-PGF-CTES-2023-24
2
 18 robustesse basse doute bis
152
 Domaines conservés: INTERPRO
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Messages Lecteurs Sujet
24 Nov 2022 15:00 LesPerdus BioCell2022
1
 30 Petit problème sur la recherche de domaines protéiques INTERPRO
1 May 2022 17:41 SRSM Bioch2022
2
 11 Choix du domaine
11 Apr 2022 23:00 Sylia Bioch2022
3
 46 Domaine protéique non conservé dans la famille
26 Mar 2022 12:10 mongeoussada Bioch2022
2
 32 Choix du domaine retenu
13 Oct 2021 20:01 ilonaMi Master-Mer-2021
3
 38 Choix du profil Interpro pour table 2
13 Oct 2021 19:57 ilonaMi Master-Mer-2021
1
 8 Choix du profil Interpro pour table 2
13 Oct 2021 19:56 ilonaMi Master-Mer-2021
1
 9 Choix du profil Interpro pour table 2
4 Oct 2021 18:16 emmaRO Master-Mer-2021
2
 33 Domaines protéiques à annoter
27 Sep 2021 17:42 Thibault_A Master-Mer-2021
2
 36 Domaines protéiques INTERPRO
20 Sep 2021 11:15 ilonaMi Master-Mer-2021
2
 34 Base de données
55
 Fonctions moléculaires & Processus biologiques
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Messages Lecteurs Sujet
28 Apr 2024 19:10 julien12138 WutAMU2024
1
 6 Dernière version non sauvegardée
18 Apr 2024 10:27 B_WIRTH_WUT_24 WutAMU2024
2
 30 Message de HU Yinghua (séquence HMP2_11687030)
28 Apr 2023 16:46 B_Wirth_23 Bioch2023
1
 7 Absence de processus biologique dans Interpro
28 Apr 2023 16:32 B_Wirth_23 Bioch2023
1
 4 Symbole de gène
29 Apr 2022 11:21 Faiznaleann Bioch2022
4
 35 Contradiction
28 Apr 2022 10:37 B_Wirth_22 Bioch2022
1
 14 Choix du Processus biologique
21 May 2019 18:52 DebB L3-PGF-CTES-2018
3
 53 Doute sur le groupe d'étude et la séquence analysée
12 May 2018 23:15 MissDia95 Bioch2018
1
 14 Classification de l'ORF
24 Feb 2017 16:24 ClaraSophie Bioch2017
2
 48 Domaine proteique
23 Feb 2017 14:22 Vincent-Marine Bioch2017
3
 77 Choix de la fonction/processus et gène
129
 Conclusion
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Messages Lecteurs Sujet
28 Dec 2023 16:23 odessaH L3-PGF-CTES-2023-24
2
 21 source fonction
26 Nov 2023 0:55 Yael L3-PGF-CTES-2023-24
2
 30 longueur de la conclusion
26 Nov 2023 0:40 Yael L3-PGF-CTES-2023-24
2
 32 identifier les branches de l'arbre phylogénétique avec des lettres
17 Nov 2023 13:50 Yael L3-PGF-CTES-2023-24
2
 24 choix du nom scientifque à mettre dans la conclusion
12 Oct 2022 12:16 IMalki L3-PGF-2022
1
 20 Pour sars Cov 1
28 Sep 2022 14:18 LILYROSEPGF L3-PGF-2022
1
 21 J'ai trouvé des nouveaux génomes + génome privé
27 Sep 2022 17:48 P_Hingamp_PGF22 L3-PGF-2022
1
 14 Paru hier : article "Origine du SARS-CoV-2 et du Covid-19 : le point sur l’enquête en cours et les dernières hypothèses"
26 Sep 2022 18:51 P_Hingamp_PGF22 L3-PGF-2022
1
 12 Le virus qui venait du froid...
23 Sep 2022 10:38 hoda1 L3-PGF-2022
1
 21 J'ai trouvé le génome complet de la souche BANAL-20-52/Laos/2020 identifiée par l'Institut Pasteur
22 Sep 2022 20:27 LILYROSEPGF L3-PGF-2022
1
 22 J'ai trouvé le génome complet de SARS-Cov1 (Souche Tor2)